Вплив харчових кормів на співвідношення концентратів на динамічні зміни профілю та взаємодію мікробіоти та метаболітів жуйних у телиць Гольштейна

Джун Чжан

1 Державна ключова лабораторія харчування тварин, Пекінський науково-дослідний центр інженерних технологій контролю якості та безпечності необробленого молока, Коледж науки і технологій тварин, Китайський сільськогосподарський університет, Пекін, Китай

вплив

Хайтао Ши

1 Державна ключова лабораторія харчування тварин, Пекінський науково-дослідний центр інженерних технологій контролю якості та безпечності необробленого молока, Коледж науки і технологій тварин, Китайський сільськогосподарський університет, Пекін, Китай

2 Кафедра тваринництва та птахівництва, Університет Саскачевана, Саскатун, СК, Канада

Яджин Ван

1 Державна ключова лабораторія харчування тварин, Пекінський науково-дослідний центр інженерних технологій контролю якості та безпечності необробленого молока, Коледж науки і технологій тварин, Китайський сільськогосподарський університет, Пекін, Китай

Шенлі Лі

1 Державна ключова лабораторія харчування тварин, Пекінський науково-дослідний центр інженерних технологій контролю якості та безпечності необробленого молока, Коледж науки і технологій тварин, Китайський сільськогосподарський університет, Пекін, Китай

Чжицзюнь Цао

1 Державна ключова лабораторія харчування тварин, Пекінський дослідницький центр інженерних технологій контролю якості та безпеки сирого молока, Коледж науки і технологій тварин, Китайський сільськогосподарський університет, Пекін, Китай

Шокун Джи

1 Державна ключова лабораторія харчування тварин, Пекінський дослідницький центр інженерних технологій контролю якості та безпеки сирого молока, Коледж науки і технологій тварин, Китайський сільськогосподарський університет, Пекін, Китай

Юань Хе

1 Державна ключова лабораторія харчування тварин, Пекінський науково-дослідний центр інженерних технологій контролю якості та безпечності необробленого молока, Коледж науки і технологій тварин, Китайський сільськогосподарський університет, Пекін, Китай

Хунтао Чжан

1 Державна ключова лабораторія харчування тварин, Пекінський науково-дослідний центр інженерних технологій контролю якості та безпечності необробленого молока, Коледж науки і технологій тварин, Китайський сільськогосподарський університет, Пекін, Китай

Пов’язані дані

Анотація

Вступ

Рубець - складна мікробна екосистема, в якій мешкає висока щільність мікробіоти, в якій задіяні бактерії, інфузорій найпростіші, анаеробні гриби та археї (Hobson and Stewart, 1997). Мікроорганізми рубця відіграють важливу роль у деградації кормів та виробництві летких жирних кислот (VFA), лактату, амінокислот, ліпідів та водню, які мають вирішальне значення для підтримання, росту та продуктивності жуйних тварин (Shabat et al., 2016). Через складність екосистеми рубця, краще розуміння мікробіоти рубця в екстенсивних умовах годівлі є необхідною передумовою маніпуляцій мікробіотою рубця з метою оптимізації функції рубця та підвищення ефективності кормів (Jami and Mizrahi, 2012; Bannink et al., 2016).

В даний час нещодавно розроблена високопродуктивна методика секвенування MiSeq успішно використовується для виявлення змін та функцій спільноти бактерій жуйних (Mao et al., 2015; Jin et al., 2016; Ye et al., 2016). Комплексне дослідження складу та чисельності бактерій жуйних, інфузорій, грибів та архей могло б дати краще розуміння мікробіоти у телиць з обмеженим вигодовуванням з високим вмістом раціону. Ми припустили, що широкий спектр дієтичних F: C впливає на мікробіоти і метаболіти жуйних. Метою цього дослідження, використовуючи чотири дієтичні рівні F: C, було оцінити як лінійні, так і нелінійні ефекти збільшення частки харчового концентрату на жуйних профілях мікробіоти (бактерії, найпростіші, анаеробні гриби та археї) та метаболіти у телиць Голштейна з обмеженим харчуванням завдяки поєднанню стратегії послідовності MiSeq та техніки GC-TOF/MS. Більше того, у цьому дослідженні також аналізували взаємозв'язок між кількістю мікробіоти жуйних речовин та їх метаболітами.

Матеріали і методи

Тварини, дієти та експериментальний дизайн

Це дослідження було проведено відповідно до рекомендацій Інструктивних понять щодо догляду за експериментальними тваринами, Міністерство науки і технологій Китаю. Протокол був схвалений Етичним комітетом Коледжу тваринницьких наук та технологій Китайського сільськогосподарського університету.

Збір та вимірювання зразків рубця

Вилучення ДНК мікробів, ампліфікація ПЛР, секвенування ilumina miseq та обробка даних секвенування

Таблиця 1

На параметри бродіння рубця впливає підвищення рівня концентрату в дієтах.