Геномний контроль для досліджень асоціацій

Департамент психіатрії, Пітсбурзький університет, 3811 O'Hara Street, Pittsburgh, Pennsylvania 15213 email: [email protected]

Департамент статистики, Університет Карнегі-Меллона, 5000 Форбс-авеню, Пітсбург, Пенсільванія 15213 електронна пошта: [email protected]

Департамент психіатрії, Пітсбурзький університет, 3811 O'Hara Street, Pittsburgh, Pennsylvania 15213 email: [email protected]

Анотація

Резюме. Очікується, що найближчим часом буде доступний щільний набір однонуклеотидних поліморфізмів (SNP), що охоплює геном, та ефективний метод оцінки генотипів SNP. Вирішене питання полягає в тому, як ефективно використовувати ці технології для виявлення генів, що впливають на відповідальність за складні розлади. Для досягнення цієї мети ми пропонуємо статистичний метод, який має декілька оптимальних властивостей: його можна використовувати з даними контролю випадків, і все ж, як на основі сімейних конструкцій, контролю гетерогенності популяції; вона нечутлива до звичайних порушень припущень моделі, таких як випадки, коли вони не є суворо незалежними; і, використовуючи байєсівські методи, він уникає необхідності корекції Бонферроні для кількох тестів, що призводить до кращої роботи в багатьох налаштуваннях, одночасно обмежуючи ризик помилкових спрацьовувань. Ефективність нашого геномного методу контролю є досить хорошою для правдоподібних ефектів генів відповідальності, що є гарним підставою для майбутніх генетичних аналізів складних порушень.