Сумоїляція регулює функцію ламіна А і втрачається у мутантів ламіна А, пов’язаних із сімейними кардіоміопатіями

  • Стандартний вид
  • Перегляд значок Перегляди
    • Зміст статті
    • Цифри та таблиці
    • Відео
    • Аудіо
    • Додаткові дані

  • Посилання PDF PDF
  • Поділитися піктограмою Поділіться
    • Facebook
    • Twitter
    • LinkedIn
    • Електронна пошта
  • Значок Інструменти Інструменти

    • Ю-Цянь Чжан, Кевін Д. Сардж; Сумоїляція регулює функцію ламіна А і втрачається у мутантів ламіна А, пов’язаних із сімейними кардіоміопатіями. J Cell Biol 14 липня 2008 р .; 182 (1): 35–39. doi: https://doi.org/10.1083/jcb.200712124

      сумоилирование

      Завантажити файл цитування:

      Мутації ламіну А викликають багато захворювань, включаючи кардіоміопатії та синдром Прогерії. Ковалентне приєднання малих убиквитиноподібних модифікаторів (SUMO) поліпептидів регулює функцію багатьох білків. До цих пір не було відомо жодних прикладів мутацій, що викликають захворювання людей, які виникають у межах консенсусної послідовності сумоилирования та змінюють сумоилирование. Ми показуємо, що ламін А сумоилирован в лізині 201 і що два мутанта ламіну А, пов'язані із сімейною дилатаційною кардіоміопатією, E203G та E203K, демонструють знижене сумоилирование. E203 займає збережену позицію +2 у консенсусі щодо сумоїляції ΨKXE. Мутанти Lamin A E203G, E203K та K201R мають подібну аберантну субклітинну локалізацію і пов’язані зі збільшенням загибелі клітин. Фібробласти особини з мутацією ламіна A E203K також виявляють знижене сумоилювання ламіна А та збільшену загибель клітин. Ці результати свідчать про те, що модифікація SUMO важлива для нормальної функції ламіна A та передбачає участь у зміненому сумоилировании в кардіоміопатіях E203G/E203K ламіна A.

      Вступ

      Білок ламіна А відіграє важливу роль у структурі та функції ядра, а мутації гена ламіна А викликають велику кількість різних захворювань людини, включаючи кардіоміопатії, м'язові дистрофії та синдром Хатчінсона-Гілфорда Прогерії (Broers et al., 2006; Capell and Collins, 2006; Mattout et al., 2006; Parnaik and Manju, 2006). Ковалентне приєднання малих білків, подібних до убіквітин-модифікатора (SUMO), до залишків лізину в цільових білках, або сумоилирование, є важливим регулятором функціональних властивостей білка (Hay, 2005; Bossis and Melchior, 2006; Kerscher et al., 2006). Білки SUMO ковалентно приєднуються до цільових залишків лізину ферментом SUMO E2 ubc9, і ці субстратні лізини, як правило, знаходяться в консенсус-послідовності ΨKXE (Ψ являє собою гідрофобні амінокислоти; Desterro et al., 1997; Johnson and Blobel, 1997; Rodriguez et al., 2001; Sampson et al., 2001). Клітини експресують три основні паралоги SUMO, SUMO-1, SUMO-2 та SUMO-3, причому SUMO-2 та -3 набагато більше схожі між собою, ніж на SUMO-1 (Hay, 2005; Kerscher et al., 2006; Bossis and Melchior, 2006).

      За допомогою двогібридного скринінгу дріжджів попереднє дослідження виявило взаємодію між ламіном А та ubc9, білком SUMO E2 (Zhong et al., 2005). Виходячи з цієї взаємодії, ми висунули гіпотезу, що білок ламіну А може бути об’єктом сумоилирования. Метою експериментів у цьому дослідженні було визначити, чи справді ламін А сумоилирован в клітинах, і якщо так, то яку роль ця модифікація відіграє в регуляції функції цього ламіна.

      Результати і обговорення

      По-перше, ми прагнули протестувати на сумоилирование ендогенного ламіна А шляхом проведення імунопреципітації екстрактів клітин HeLa з використанням антитіл ламіна А, а потім Вестерну з використанням антитіл проти SUMO-1 або SUMO-2/SUMO-3 (через подібність SUMO-2 і -3, цілком ймовірно, що обидва ці білки SUMO розпізнаються цим антитілом). Результати дозволяють припустити, що ламін A модифікований SUMO і що він переважно модифікований SUMO-2 порівняно з SUMO-1 (рис. 1 A). Результати на рис. 1 С вказують, що білок ламіну А в екстрактах серця миші також сумоилирован і що, як і ламін А, який присутній у екстрактах клітин HeLa, SUMO-2, здається, є переважним білком SUMO, приєднаним до цього білка.

      Аналіз амінокислотної послідовності ламіна А виявив збіг з консенсусною послідовністю сумоилирования ΨKXE (MKEE), що оточує лізин 201, у стрижневому домені ламіна А (рис. 2 А, вгорі). Щоб перевірити, чи відбувається сумоилирование ламіна А в лізині 201, клітини HeLa трансфікували експресійними плазмідами ссавців, що кодують злиті конструкції GFP дикого типу ламіна А та ламіна А, в яких цей лізин замінювали на несумоїдуючий аргінін (K201R). з конструкціями виразів, що кодують SUMO-1 або -2 із позначенням HA. Екстракти трансфікованих клітин піддавали імунопреципітації антитілами проти GFP з подальшим анти-HA вестерн-блот. Результати цього експерименту, узгоджуючись з результатами, отриманими для ендогенного ламіна А, показали, що білок ламіна А дикого типу ковалентно модифікований SUMO-2, але не настільки ефективно сумоилирован SUMO-1 (рис. 2 А, внизу) . Результати також показують, що модифікація за допомогою SUMO-2 не спостерігається для мутантного білка K201R ламіна A, що дозволяє припустити, що лізин 201 є місцем прикріплення SUMO-2 у цьому білку.

      Щоб підтвердити ефекти зміненої локалізації мутантів E203G та E203K ламіна A, пов’язаних із кардіоміопатією, у більш фізіологічно значущому типі клітин, ми повторили експерименти, показані на рис. 3 А, у ембріональних кардіоміоцитах мишей. Результати, показані на рис. 3 Б, вказують на те, що всі мутанти K201R, E203G та E203K ламіна A демонструють аберантні закономірності локалізації в кардіоміоцитах (порівняно з динамічним типом ламіна А), подібні до тих, що спостерігаються в клітинах HeLa. Відсоток клітин, що виявляють аномальну локалізацію дикого типу та мутантного GFP-ламіна A, наведено в таблиці S1.

      У світлі дефектних моделей сумоилирования та аберантної локалізації мутантних білків K201R, E203G та E203K ламіна A ми припустили, що експресія цих мутантних білків ламіна A може призвести до зниження життєздатності клітин. Результати, показані на рис. 3 С, вказують, що це, мабуть, так, оскільки всі три з цих мутантних білків ламіну А пов’язані зі збільшенням загибелі клітин.

      В остаточному наборі експериментів ми дослідили фібробласти шкіри, отримані від пацієнта, який є гетерозиготним за мутацією ламінату E203K, яка, як уже було описано, асоціюється з кардіоміопатією (Jakobs et al., 2001). Імунопреципітація ламіну А з цих клітин з подальшим вестерн-блот-процесом SUMO-2 вказує на те, що, як очікувалося, рівні сумоилирования ламіна А знижуються в клітинах цієї особини порівняно з клітинами нормальної особини (рис. 4 А). Ця особина гетерозиготна щодо мутації ламіна A E203K, отже, ми очікуємо, що сумоилирование ламіна А було зменшено, але не ліквідовано. Крім того, імунофлуоресцентний аналіз ламіна А показав більше клітин, що демонструють аномальну локалізацію ламіна А та ядерну морфологію для фібробластів E203K порівняно з нормальними фібробластами (рис. 4 Б). Відсотки нормальних та E203K фібробластів, що мають аномальну локалізацію ламіна A/ядерну морфологію, наведені в таблиці S1. Фібробласти E203K також демонструють підвищену загибель клітин у порівнянні з контрольними фібробластами (рис. 4 С).

      Результати, представлені в цій роботі, вказують на те, що лізин 201 ламіну А є мішенню ковалентної модифікації білком SUMO-2 і що це сумоилирование є важливим для нормальної моделі субклітинної локалізації білка ламіна А. Результати цих експериментів також показують, що сумоилирование ламіна A знижується у трансфікованих мутантних білках E203G та E203K ламіна A, що спричиняють сімейні дилатаційні кардіоміопатії, та в ламіні A фібробластів осіб з мутацією E203K. Наскільки нам відомо, це перші приклади мутацій, що викликають захворювання людини, що відбуваються у вирішальному залишку послідовності консенсусу сумоилирования і призводять до зменшення сумоилирования мутантного білка.

      Результати також вказують на те, що мутантні білки E203G та E203K ламіна A демонструють змінені схеми субклітинної локалізації, які дуже схожі на схеми прикріплення SUMO у мутантного білка ламіна A A201. Ці результати свідчать про роль сумоилирования в правильній локалізації ламіна А в клітині. Крім того, клітини, трансфіковані білками E203G та E203K ламіна A та фібробласти шкіри осіб з мутацією E203K, демонструють більш високий рівень загибелі клітин у порівнянні з клітинами, трансфікованими ламіном A дикого типу або фібробластами нормальної шкіри. Разом ці результати дозволяють припустити, що сумоилирование є важливим для нормальної функції ламіна A та підтримують роль зміненого сумоилирования в основному молекулярному механізмі сімейних розширених кардіоміопатій, пов’язаних з мутаціями E203G/E203K ламіна A.

      Матеріали і методи

      Культура клітин та плазміди

      Імунопреципітаційний аналіз

      Вестерн-блот-аналіз та антитіла

      SDS-PAGE та вестерн-блот проводили згідно стандартних процедур. Антитіла та розведення, які використовували для зондування вестерн-блот, були наступними. Козяче антитіло до GFP (Bethyl Laboratories, Inc.) використовували при співвідношенні 1: 2 000, антитіло до HA миші (подарунок лабораторії Д. Андреса, Університет Кентуккі, Лексінгтон, штат Кентуккі) застосовували при 1: 2000, козяче антитіло - Антитіло до SUMO-1 (Bethyl Laboratories, Inc.) використовували при співвідношенні 1: 1000, антитіла до кролика - до SUMO-2 (Abgent) застосовували при 1: 500, а антитіла до кролика проти ламіна A (Abcam) застосовували при 1: 500.

      Флуоресцентна та імунофлуоресцентна мікроскопія

      Аналіз життєздатності синіх клітин трипану

      Клітини збирали центрифугуванням при 1000 об/хв протягом 10 хв при 4 ° С і гранулу двічі промивали PBS. Потім клітинну гранулу ресуспендували в PBS до концентрації ~ 10 6 клітин/мл. Розведення суспензії один до одного готували із застосуванням розчину, що містить 0,4% плями трипанового синього (Invitrogen), а потім суспензію завантажували в лічильну камеру гемацитометра. Підраховували кількість пофарбованих клітин, а також загальну кількість клітин, і відсоток пофарбованих клітин приймали як відсоток загибелі клітин. Для кожного експерименту було проаналізовано три набори даних.

      Статистичний аналіз

      Статистичну значимість визначали за допомогою критерію t Стьюдента. Значення р 2-вільного буфера для травлення, що містить 0,5 мг/мл колагенази (тип II; Вортінгтон) та 1 мг/мл панкреатину протягом двох 15-хвилинних циклів. Перетравлена ​​тканина дала велику частку одиничних спонтанно битих клітин у культуральному середовищі, що складається з DME, що містить 10% FBS.

      Інтернет-додатковий матеріал

      Таблиця S1 містить кількісний аналіз для експериментів на рис. 3 (A і B) та рис. 4 B. Ця таблиця показує відсоток клітин HeLa або кардіоміоцитів, трансфікованих мутантами дикого типу GFP ламіна A, K201R, E203G або E203K, які демонструють аномальну локалізацію ламіна A та відсотки нормальної порівняно з E203K ламіна A фібробласти, що демонструють аномальну локалізацію ламіна A/ядерну морфологію.

      Абревіатура, використана в цій роботі: SUMO, невеликий модифікатор, схожий на убиквітин.

      Подяка

      Ми дуже вдячні доктору Рей Хершбергеру за надання фібробластів шкіри від нормальних осіб та осіб E203K з ламіном А, доктору Нанберту Чжунгу та доктору В. Теду Брауну за плазміду pcDNA3.1-LMNA, доктору Кіму Орту для HA – SUMO -1 та експресійні плазміди HA – SUMO-2, доктор Дуг Андрес за антитіла до HA, а Вільям Лестер та д-р Джон Сатін за добрий подарунок ембріональних кардіоміоцитів. Ми також дякуємо членам нашої лабораторії за глибокі дискусії.

      Це дослідження було підтримане грантом Національного інституту охорони здоров'я GM64606 K.D Sarge.