Дієта, збагачена волоським горіхом, впливає на мікробіом кишечника у здорових кавказьких суб’єктів: рандомізоване контрольоване дослідження

Блок-схема навчальних предметів. Загалом було рандомізовано 204 суб’єкти. У аналіз стільця були включені 142 суб'єкти. 7 пацієнтів були виключені через антибіотикотерапію. Загалом, до статистичної оцінки були включені зразки калу від 135 досліджуваних. СН: обмеження вуглеводів; F: обмеження жиру; Гребінець: комбіноване обмеження вуглеводів та жирів.

В межах вибірки альфа-різноманітність стільця кожного суб'єкта, зібраного в кінці кожної фази дієти. Розрахунок альфа-різноманітності для кожної вибірки (синій: дієта з горіха, червоний: контрольна дієта) для оцінки видового багатства та різноманітності за допомогою ефективних індексів Шеннона та Сімпсона. Різноманітність мікробного профілю для певного індексу - це кількість різних видів, пов’язаних з чисельністю та багатством.

(а) Бета-різноманітність між волоським горіхом та контрольною дієтою. Виразне скупчення спостерігалось між волоським горіхом та контрольною дієтою. Використовуючи узагальнені відстані UniFrac, враховуючи філогенетичну відстань між оперативними таксономічними одиницями, графік MDS вказує на значні відмінності приблизно 5% між волоським горіхом та контролем (p = 0,02). Багатовимірна матриця відстані у просторі двох вимірів візуалізується як графік MDS. Кластеризація та забарвлення обстежуваного проводились відповідно до типу дієти. Кожний кінець крапки вказує позицію зразка в наборі даних мікробіоти (синій: дієта з горіховим горіхом, червоний: контрольна дієта). (b) Бета-різноманітність між трьома різними типами дієти під час споживання волоських горіхів. Між дієтами спостерігалося чітке скупчення. Використовуючи узагальнені відстані UniFrac, враховуючи філогенетичну відстань між оперативними таксономічними одиницями, графік MDS вказує на суттєві відмінності приблизно 5% між різними дієтами (p = 0,026). Багатовимірна матриця відстані у просторі двох вимірів візуалізується як графік MDS. Кластеризація та забарвлення обстежуваного проводились відповідно до типу дієти. Кожен кінець крапки вказує позицію зразка в наборі даних мікробіоти (червоний: d_1: обмеження вуглеводів; зелений: d_2: обмеження жиру; синій: d_3: обидва).

(а) Відносна кількість 4 домінуючих бактеріальних видів між волоським горіхом та контрольною дієтою. Споживання волоського горіха змістило переважну філу з Firmicutes (61,2% після споживання волоських горіхів проти 63,9% після контролю) на Bacteroidetes (30,8% проти 27,4%). Відносна чисельність була розрахована на основі відносної чисельності послідовностей генів 16S рРНК для кожної бактеріальної спільноти за допомогою платформи IMNGS. (b) Найпоширеніші експлуатаційні таксономічні одиниці як для волоського горіха, так і для контрольної фази на рівні роду. Значущі різні OTU позначаються за допомогою * і p -значень. p -значення розраховували за допомогою попарного тесту Фішера.

Анотація

(а) Бета-різноманітність між волоським горіхом та контрольною дієтою. Між волоським горіхом та контрольною дієтою спостерігалося чітке скупчення. Використовуючи узагальнені відстані UniFrac, враховуючи філогенетичну відстань між оперативними таксономічними одиницями, графік MDS вказує на значні відмінності приблизно 5% між волоським горіхом та контролем (p = 0,02). Багатовимірна матриця відстані у просторі двох вимірів візуалізується як графік MDS. Кластеризація та забарвлення обстежуваного проводились відповідно до типу дієти. Кожний кінець крапки вказує позицію зразка в наборі даних мікробіоти (синій: дієта з горіховим горіхом, червоний: контрольна дієта). (b) Бета-різноманітність між трьома різними типами дієти під час споживання волоських горіхів. Між дієтами спостерігалося чітке скупчення. Використовуючи узагальнені відстані UniFrac, враховуючи філогенетичну відстань між оперативними таксономічними одиницями, графік MDS вказує на суттєві відмінності приблизно 5% між різними дієтами (p = 0,026). Багатовимірна матриця відстані у просторі двох вимірів візуалізується як графік MDS. Кластеризація та забарвлення обстежуваного проводились відповідно до типу дієти. Кожен кінець крапки вказує позицію зразка в наборі даних мікробіоти (червоний: d_1: обмеження вуглеводів; зелений: d_2: обмеження жиру; синій: d_3: обидва).