Протеомічний аналіз зразків тканин при дослідженні трансляційного раку молочної залози

  • Повна стаття
  • Цифри та дані
  • Список літератури
  • Цитати
  • Метрики
  • Передруки та дозволи
  • Отримати доступ /doi/full/10.1586/14789450.2014.899469?needAccess=true

В останнє десятиліття багато протеомічних технологій із різним успіхом застосовувались для дослідження зразків тканин раку молочної залози для профілювання експресії білка з метою виявлення білкових біомаркерів/підписів, придатних для: характеристики та підтипу пухлин; рання діагностика, як прогноз, так і прогнозування результату хіміотерапії. Метою цього огляду є критична оцінка досягнутого на сьогоднішній день за допомогою протеомічних технологій та висунення нових стратегій, заснованих на аналізі клінічно значущих зразків, які обіцяють пришвидшити переклад основних відкриттів у щоденну клінічну практику раку молочної залози. . Зокрема, ми розглядаємо основні проблеми експериментального проектування, аналізуючи сильні та слабкі сторони сучасних протеомічних стратегій в контексті аналізу зразків тканин молочної залози людини.

аналіз

Розкриття фінансових та конкуруючих інтересів

Ця робота була підтримана Датським онкологічним товариством за рахунок бюджету Дослідницького центру та грантів фонду "Гонка проти раку молочної залози" та Фонду Джона і Бірти Мейєр. Автори не мають належних зв'язків чи фінансової взаємодії з жодною організацією чи організацією, що має фінансовий інтерес або фінансовий конфлікт із предметом або матеріалами, що обговорюються в рукописі, окрім тих, що розкриваються. Це включає працевлаштування, консультації, гонорари, володіння акціями або опціони, показання експертів, гранти чи патенти, отримані або очікувані на розгляд, або роялті.

Під час написання цього рукопису не було використано жодної допомоги.

Значного прогресу було досягнуто у технологіях виявлення протеоміки, що дозволяють поглиблено профілювати протеоми в безлічі зразків тканин раку молочної залози, що є перспективою для поліпшення розуміння прогресування раку молочної залози та у створенні нових тканинних прогностичних, діагностичних та прогнозуючих біомаркерів/або підписи.

Однак знайти білкові біомаркери, які можна впровадити в щоденну клінічну практику, виявилося не простим завданням. Багато етапів та елементів трансляційних протеомічних стратегій, що використовуються на сьогоднішній день у трансляційних дослідженнях раку молочної залози, слід критично переглянути для досягнення кращого успіху в майбутньому.

При будь-яких протеомічних проектах щодо раку молочної залози слід ретельно враховувати міркування щодо неоднорідності та пластичності внутрішньопухлин.

Наразі більшість трансляційних протеомічних досліджень, як правило, виконувались на обмеженій кількості зразків тканин з недостатніми знаннями про хворих на рак молочної залози.

Валідаційні тести зазвичай проводяться на невеликій когорті зразків, які часто погано характеризуються. Стратифікація даних, отриманих на фазі відкриття, є вирішальним кроком у створенні клінічно значущих надійних біомаркерів.