Консервований пошук доменів NCBI

муропептид MFS транспортер AmpG;

AmpG та подібні транспортери суперсімейства фасилітаторів; AmpG діє як внутрішня мембранна пермеаза в системі індукції бета-лактамази та при переробці пептидогліканів. Він транспортує мевропептид з периплазми в цитозоль у грамнегативних бактерій, що є важливим для індукції ampC, що кодує бета-лактамазу. Сімейство AmpG належить до основної фамілітаторської суперсімейки (MFS) мембранних транспортних білків, які, як вважають, функціонують через єдиний ділянку зв'язування субстрату, механізм поперемінного доступу, що включає тип руху "рокер".

AmpG-подібна пермеаза; [Клітинні процеси, пристосування до нетипових умов]

Суперсім'я основного фасилітатора;

Прогнозований пермеаз викиду арабінози, сімейство MFS [Транспорт і метаболізм вуглеводів];

муропептид MFS транспортер AmpG;

муропептидний транспортер; Переглянуто

AmpG та подібні транспортери суперсімейства фасилітаторів; AmpG діє як пермеаза внутрішньої мембрани в системі індукції бета-лактамази та при переробці пептидогліканів. Він транспортує мевропептид з периплазми в цитозоль у грамнегативних бактерій, що є важливим для індукції ampC, що кодує бета-лактамазу. Сімейство AmpG належить до основної фамілітаторської суперсімейки (MFS) мембранних транспортних білків, які, як вважають, функціонують через єдиний ділянку зв'язування субстрату, механізм поперемінного доступу, що включає тип руху "рокер".

AmpG-подібна пермеаза; [Клітинні процеси, пристосування до нетипових умов]

Головний фасилітатор надсімейного домену, що містить 3 білка; Головний фасилітатор надсімейного домену, що містить 3 білок (MFSD3), є прогнозованим транспортером ацетил-КоА. Як нетиповий передбачуваний мембранно-розчинений носій (SLC), MFSD3, швидше за все, буде функціонально активним у плазматичній мембрані, а не в жодних внутрішньоклітинних органелах. MFSD3 належить до основної фамілітаторської надсімейства (MFS) мембранних транспортних білків, які, як вважають, функціонують через єдине місце зв'язування субстрату, механізм поперемінного доступу, що включає тип руху "рокер".

сидерофорний транспортер, сімейство RhtX/FptX; RhtX від Sinorhizobium meliloti 2011 та FptX від Pseudomonas aeruginosa, здається, є одиночними транспортерами поліпептидів із родини основних фасилітаторів (див. Pfam07690) для імпорту сидерофорів як засобу для імпорту заліза. Ця функція була запропонована завдяки близькості до генів біосинтезу сидерофорів, а потім підтверджена вивченням фенотипів нокауту та гетерологічних експресій. [Транспортні та зв’язуючі білки, катіони та сполуки, що несуть залізо]

Суперсім'я основного фасилітатора;

Макролідний витікаючий білок А та подібні білки основної фасилітаторської суперсімейства транспортерів; Ця родина складається з викидного білка A макроліду Streptococcus pyogenes (MefA) та подібних транспортерів, багато з яких залишаються нехарактерними. Деякі члени можуть бути транспортерами із стійкістю до різних лікарських засобів (MDR), які є антипортаторами до наркотиків/Н + (DHA), які опосередковують витікання різноманітних ліків та токсичних сполук, надаючи стійкість до цих сполук. MefA надає стійкість до 14-членних макролідів, включаючи еритроміцин, та до 15-членних макролідів. Він функціонує як випускний насос для регулювання внутрішньоклітинного рівня макролідів. Сімейство, подібне до MefA, належить до основної фамілітаторської суперсімейки (MFS) мембранних транспортних білків, які, як вважають, функціонують через єдине місце зв'язування субстрату, механізм поперемінного доступу, що включає тип руху "рокер".

бактеріальні MdtG-подібні та еукаріотичні розчинені речовини-носії 18 (SLC18) сімейства основних фасилітаторів суперсімейства транспортерів; Це сімейство складається з транспортерів сімейства еукаріотичних розчинених речовин 18 (SLC18) та пов’язаних з ними транспортерів мультирезистентності до бактерій (MDR), що включає кілька білків кишкової палички, таких як білок мультирезистентності MdtG, Bacillus subtilis, таких як білки резистентності до багатьох ліків 1 (Bmr1) та (Bmr2), а також із золотистого стафілокока, такого як білок стійкості до хінолону NorA. Сімейство також включає транспортери викидів арабінози кишкової палички YfcJ та YhhS. Транспортери MDR - це ліки/антитіла до Н + (DHA), які опосередковують витікання різноманітних ліків та токсичних сполук та надають стійкість до цих сполук. Родина транспортерів SLC18 включає транспортери везикулярного моноаміну (VAT1 та VAT2), транспортери везикулярного ацетилхоліну (VAChT) та SLC18B1, який пропонується бути везикулярним транспортером поліаміну (VPAT). Сімейство MdtG/SLC18 належить до основної фамілітаторської суперсімейки (MFS) мембранних транспортних білків, які, як вважають, функціонують через єдине місце зв'язування субстрату, механізм поперемінного доступу за участю типу перемикача коромисла.

Ацетил-кофермент А транспортер 1; Мишачий Acatn - це гідрофобний білок 61 кДа з шістьма - 10 трансмембранними доменами. Здається, це сприяє 9-О-ацетилюванню в гангліозидах.

Escherichia coli YfcJ, YhhS та подібні транспортери суперсімейства основних фасилітаторів; Ця підродина складається з білків мембрани Escherichia coli, YfcJ та YhhS, Bacillus subtilis, нехарактерного транспортера типу MFS YwoG, та подібних білків. YfcJ та YhhS є передбачуваними транспортерами арабінозного потоку. YhhS спричиняє стійкість до гліфосату. YfcJ-подібні арабінозні викидні транспортери належать до бактеріального MdtG-подібного та еукаріотичного розчиненого розчиненого речовини 18 (SLC18) з сімейства основних фасилітаторів (MFS) транспортерів. Вважається, що білки MFS функціонують через єдиний сайт зв'язування субстрату, механізм поперемінного доступу, що включає тип руху "рокер".

Пуриновий рибонуклеозидний напірний насос NepI та подібні транспортери Суперсімейства основного фасилітатора; Ця родина складається з пуринових насосів, таких як кишкова паличка NepI та Bacillus subtilis PbuE, транспортерів цукрового потоку, таких як пермеаза Corynebacterium glutamicum арабіноза, транспортерів із стійкістю до різних лікарських засобів (MDR), таких як білок стійкості до хлорамфеніколу Streptomyces lividans та подібні білки (CmlR). NepI та PbuE беруть участь у витіканні пуринових рибонуклеозидів, таких як гуанозин, аденозин та інозин, а також пуринових основ, таких як гуанін, аденин та гіпоксантин, та аналогів пуринової основи. Вони відіграють певну роль у підтримці клітинних пулинових основ, а також у захисті клітин та наданні стійкості до токсичних аналогів пуринової основи, таких як 6-меркаптопурин. Транспортери MDR - це ліки/антитіла до Н + (DHA), які опосередковують витікання різноманітних ліків та токсичних сполук та надають стійкість до цих сполук. Сімейство, подібне до NepI, належить до основної фамілітаторської надсімейства (MFS) мембранних транспортних білків, які, як вважають, функціонують через єдине місце зв'язування субстрату, механізм поперемінного доступу, що включає тип руху "рокер".

Транспортер гексуроната, транспортер глюкарату та подібні транспортери суперсімейства основних фасилітаторів; Ця родина складається з переважно бактеріальних транспортерів гексуронату (ExuT), глюкарату (GudP), галактарату (GarP) та галактонату (DgoT). Вони опосередковують поглинання цих сполук у клітину. Вони належать до основної фасилітаторської суперсімейки (MFS) мембранних транспортних білків, які, як вважають, функціонують через єдине місце зв'язування субстрату, механізм поперемінного доступу, що включає тип руху "рокер".

YcaD та подібні транспортери суперсімейства фасилітаторів; Ця родина складається з транспортера YcaD типу MFS Escherichia coli, транспортера YfkF типу MFS Bacillus subtilis та подібних білків. Вони є нехарактерними транспортерами, що належать до Великої фасилітаторської суперсімейки (MFS) мембранних транспортних білків, які, як вважають, функціонують через єдине місце зв'язування субстрату, механізм поперемінного доступу за участю типу перемикача коромисла.

Н + білок Антипортер; [Транспортні та зв’язуючі білки, катіони та сполуки, що несуть залізо]

MFS/білок, що транспортує цукор; Це сімейство є частиною основного фасилітатора надродини мембранних транспортних білків.

Прогнозований пермеаз викиду арабінози, сімейство MFS [Транспорт і метаболізм вуглеводів];

Bacillus subtilis YxlH та подібні транспортери суперсімейства основних фасилітаторів; Ця підродина складається з Bacillus subtilis YxlH, нехарактерного транспортера YxlH типу MFS та подібних білків. Біологічна функція YxlH залишається незрозумілою. YxlH-подібна підродина належить до бактеріального MdtG-подібного та еукаріотичного розчиненого розчиненого речовини 18 (SLC18) до сімейства основних фасилітаторів (MFS) транспортерів. Вважається, що білки MFS функціонують через єдиний сайт зв'язування субстрату, механізм поперемінного доступу, що включає тип руху "рокер".

Na +/симпортер мелібіози або споріднений транспортер [Транспорт та метаболізм вуглеводів];

Сімейство транспортерів цукрового потоку (набір) з сімейства основних фасилітаторів транспортерів; Ця родина складається з транспортерів цукру, таких як цукровий переносник цукрової палички SetA, SetB, SetC та інших транспортерів цукру. SetA, SetB та SetC беруть участь у витіканні цукрів, таких як лактоза, глюкоза, IPTG та заміщені глюкозиди або галактозиди. Вони можуть брати участь у детоксикації аналогів цукру, що не піддаються метаболізму. Сімейство Сет належить до основної фамілітаторської сімейства (MFS) мембранних транспортних білків, які, як вважають, функціонують через єдине місце зв'язування субстрату, механізм поперемінного доступу, що включає тип руху "рокер".

Транспортер типу MFS YcxA та подібні білки основної фамілітаторської суперсімейства транспортерів; Ця група складається з нехарактерних бактеріальних транспортерів типу MFS, включаючи Bacillus subtilis YcxA та YbfB. Показано, що YcxA сприяє експорту сурфактину в B. subtilis. YcxA-подібна група належить до монокарбоксилатного транспортерного (MCT-подібного) сімейства основного фасилітатора надродини (MFS) мембранних транспортних білків. Вважається, що білки MFS функціонують через єдиний сайт зв'язування субстрату, механізм поперемінного доступу, що включає тип руху "рокер".

Метазойний синаптичний пухирчастий глікопротеїн 2 (SV2) та пов’язані з ним невеликі молекулярні транспортери основної фамілітаторської суперсімейства; Ця родина складається з метазойних синаптичних пухирців глікопротеїну 2 (SV2) та пов'язаних з ними малих молекул-транспортерів, включаючи ті, що транспортують неорганічний фосфат (Pht), ароматичні сполуки (PcaK та споріднені білки), пролін/бетаїн (ProP), альфа-кетоглутарат (KgtP), цитрат (CitA), шикімат (ShiA) та цис, цис-муконат (MucK), серед інших. SV2 - це білок, подібний до транспортера, який служить рецептором нейротоксину ботуліну А (BoNT/A), одного з семи нейротоксинів, що продукуються бактерією Clostridium botulinum. BoNT/A блокує вивільнення нейромедіатора, розщеплюючи асоційований з синаптосомою білок 25 кД (SNAP-25) в пресинаптичних нервових кінцевих клітинах. Також до цієї родини входить білок, пов’язаний із синаптичним міхуром 2 (SV2) (SVOP) та подібні білки. SVOP - це подібний до транспортера білок, що зв’язує нуклеотиди, який локалізується у везикулах, що містять нейромедіатор. SV2-подібне сімейство належить до основної фамілітаторської суперсімейки (MFS) мембранних транспортних білків, які, як вважають, функціонують через єдине місце зв'язування субстрату, механізм поперемінного доступу, що включає тип руху "рокер".

Транспортер шикімату та подібні білки основної фамілітаторської суперсімейства; Ця підродина складається з шикіматного транспортера Escherichia coli (ShiA), транспортного білка метаболіту внутрішньої мембрани YhjE та інших передбачуваних транспортерів метаболітів. ШиА бере участь у поглинанні шикімату, ароматичної сполуки, яка бере участь у біосинтезі сидерофорів. Існує припущення, що YhjE може опосередковувати поглинання осмопротекторів. Подібне сімейство ShiA належить до глікопротеїну метазойської синаптичної везикули 2 (SV2) та спорідненого сімейства транспортерів малих молекул (SV2-подібне) основної фамілітаторської надсімейства (MFS) мембранних транспортних білків. Вважається, що білки MFS функціонують через єдиний сайт зв'язування субстрату, механізм поперемінного доступу, що включає тип руху "рокер".

Оксалат: форміатний антипортер (OFA) та подібні білки основної фамілітаторської суперсімейства транспортерів; Ця підродина складається з оксалату Oxalobacter formigenes formiate-antiporter (OFA або OxlT) та подібних білків. O. formigenes, коменсал, що міститься в кишечнику тварин і людини, відіграє важливу роль у очищенні дієтичного оксалату від кишкового тракту, що здійснюється OFA/OxlT, аніонним транспортером, що полегшує обмін двовалентного оксалату з одновалентним форматом, продукт декарбоксилювання оксалату. Цей обмін генерує електрохімічний градієнт протонів і є джерелом енергії для синтезу АТФ у цій клітині. OFA-подібна підродина належить до монокарбоксилатного транспортерного (MCT-подібного) сімейства основного фасилітатора надродини (MFS) мембранних транспортних білків. Вважається, що білки MFS функціонують через єдиний сайт зв'язування субстрату, механізм поперемінного доступу, що включає тип руху "рокер".

Суперсім'я основного фасилітатора;

Білок мультирезистентності білка MdtH та подібні мультирезистентні резистентності (MDR) транспортери основної фамілізаторської суперсімейства; Це сімейство складається з кишкової палички MdtH та подібних мультирезистентних переносників (MDR) від бактерій та архей, багато з яких залишаються нехарактерними. Транспортери MDR - це ліки/антитіла до Н + (DHA), які опосередковують витікання різноманітних ліків та токсичних сполук та надають стійкість до цих сполук. MdtH надає стійкість до норфлоксацину та еноксацину. Транспортери MDR, подібні MdtH, належать до основної фамілітаторської суперсімейства (MFS) мембранних транспортних білків, які, як вважають, функціонують через єдине місце зв'язування субстрату, механізм поперемінного доступу, що включає тип руху "рокер".

Мархлер-Бауер А та ін. (2017), "CDD/SPARCLE: функціональна класифікація білків за допомогою архітектур доменів підсімейства.", Нуклеїнові кислоти Res.45(Г) 200-3.
Мархлер-Бауер А та ін. (2015), "CDD: Консервована база даних доменів NCBI.", Нуклеїнові кислоти Res.43(D) 222-6.
Мархлер-Бауер А та ін. (2011), "CDD: Збережена база даних доменів для функціональної анотації білків.", Нуклеїнові кислоти Res.39(Г) 225-9.
Марчлер-Бауер А, Брайант Ш. (2004), "CD-пошук: анотації доменів білків на льоту"., Нуклеїнові кислоти Res.32(Ш) 327-331.

Клацніть на трикутник, щоб переглянути деталі про функцію, включаючи багаторівневе вирівнювання послідовності вашого запиту та білкові послідовності, що використовуються для курації доменної моделі, де хеш-знаки (#) над вирівняними послідовностями показують розташування збережених залишків об’єкта.