Втрата різноманітності мікробіоти після аутологічної трансплантації стовбурових клітин порівнянна з травмою при алогенній трансплантації стовбурових клітин

  • Розділений екран
  • Поділитися піктограмою Поділіться
    • Facebook
    • Twitter
    • LinkedIn
    • Електронна пошта

  • Значок Інструменти Інструменти

    • Нілуфер Хан, Джонатан У. Пелед, Антоніо Л.К. Гомес, Шон М Девлін, Карлос Рондон-Клаво, Аннелі Кларман, Джон Б. Слінгерланд, Ен Е. Слінгерленд, Моллі Малой, Ентоні Д. Сунг, Нельсон Дж. Чао, Крейг С. Сотер, Хізер Дж. Ландау, Доріс Понсе, Богларка Дюркоча, Гуньян Л. Шах, Майкл Скордо, Парастуг Б. Дахі, Мігель-Анхель Пералес, Роберт Р. Дженк, Серхіо Жиральт, Ерік Г. Памер, Марсель Р.М. ван ден Брінк; Втрата різноманітності мікробіоти після аутологічної трансплантації стовбурових клітин порівнянна з травмою при алогенній трансплантації стовбурових клітин. Кров 2018; 132 (додаток 1): 608. doi: https://doi.org/10.1182/blood-2018-99-110857

      втрата

      Завантажити файл цитування:

      Анотація

      Раніше ми повідомляли, що під час алогенної трансплантації гемопоетичних стовбурових клітин (алло-HSCT) спостерігається клінічно значуще, різке зменшення різноманітності бактерій в кишечнику. Це, ймовірно, пов’язано з впливом антибіотиків, харчовими змінами та пошкодженням слизової оболонки кишечника внаслідок хіміотерапії високими дозами. Пацієнти, які проходять аутологічну трансплантацію гемопоетичних стовбурових клітин (AHCT), також отримують антибіотики та відчувають харчові зміни через мукозит та інші шлунково-кишкові токсичні явища. Ми висунули гіпотезу, що характер дисбіозу, який спостерігається у пацієнтів з АГКТ, відображатиме зміни у пацієнтів з алло-ГСКТ. Тут ми представляємо новий аналіз різноманітності мікробіоти у пацієнтів з АГКТ з двох незалежних установ.

      Ми ретроспективно виявили когорту з 365 пацієнтів (середній вік 60 років), які пройшли АГКТ для лікування гематологічної злоякісної пухлини з травня 2009 року по лютий 2018 року в двох великих трансплантаційних центрах у США. Населення було різноманітним з точки зору гістології, режимів кондиціонування та статусу ремісії до трансплантації: 179 (49%) пацієнтів з діагнозом розсіяна мієлома, 153 (42%) пацієнтів з діагнозом лімфома та 33 (9%) пацієнтів з іншими захворюваннями.

      Зразки стільця у вибраних пацієнтів збирали приблизно щотижня під час стаціонарної госпіталізації. Секвенування області V4-V5 бактеріальних генів 16S рРНК з усіх зразків проводили на платформі Illumina на центральній ділянці. Мікробну різноманітність вимірювали за допомогою індексу взаємного a-різноманітності Сімпсона (S). Ми визначили період до AHCT як дні -10 до 0 та обчислили медіанні значення для пацієнтів з кількома зразками протягом цього періоду. Ми додатково визначили монодомінацію мікробіоти як єдину операційну таксономічну одиницю, що становить> 30% від кількості бактерій.

      Для порівняння ми відстежили зразки 17 здорових добровольців та використали загальнодоступний набір послідовностей 313 здорових добровольців з проекту NIH Human Microbiome Project (HMP). Середнє мікробне різноманіття до трансплантації у здорового пацієнта та груп AHCT порівнювали парним тестом Вількокса з ретроспективною когортою пацієнтів з алло-HSCT.

      Ми оцінили 857 зразків від 365 дорослих пацієнтів, які перенесли АГКТ, з 316 пацієнтів з Центру раку Меморіал Слоун Кеттерінг (MSKCC) та 49 пацієнтів з Медичного центру Університету Дьюка (DUMC).

      Медіана різноманітності до трансплантації у пацієнтів з АГКТ з обох центрів була значно нижчою, ніж у звичайних контролях (рис. 1А) (HMP проти MSKCC AHCT, S = 12,05 проти 9,19, р 50% до дня 0 та становила> 75% до дня +14.

      Різноманітність мікробів зменшується перед трансплантацією як у пацієнтів з AHCT, так і з алло-HSCT. Втрата різноманітності після AHCT відбувається в різних центрах, і ступінь травми порівнянна з дисбіозом у пацієнтів з алло-HSCT. Попередній аналіз припускає, що менша різноманітність може корелювати з гіршим виживанням без прогресування захворювання (ПГС) у хворих на мієлому в нашій різноманітній когорті AHCT. Враховуючи відомі асоціації змін у складі мікробіоти з токсичністю та загальною виживаністю у хворих на алло-ГСКТ, подальша оцінка пошкодження мікробіоти та її асоціацій з токсичністю, ПФС та загальною виживаністю (ОС) у хворих на АГКТ є необхідною.

      A: Середній показник взаємного коефіцієнта різноманітності (S) Сімпсона для передтрансплантаційних (днів -10 до 0) зразків пацієнтів з AHCT та алло-HSCT з двох центрів, а також двох когорт здорових добровольців, був побудований і в парі Проводили тест Вількокса із значеннями р, як зазначено. B: (S) будували графіком щодо часу щодо ало-HSCT (на L) та AHCT (на R), для зразків, зібраних з дня -10 по день +30. Більші значення вказують на більшу різноманітність. С: Склад мікробіоти та зміни бактеріальної монодомінації після трансплантації (дні -14 до +28); найпоширеніший рід після трансплантації - стрептокок.