Транзиторне секвенування транскриптома N-6-метиладенозину виявляє регуляторну роль m6A у зрощуванні

Дозвільна картина m6A з високою роздільною здатністю на зароджуваних транскриптах РНК

m6A осідає в зароджувальній РНК та в інтронах

Осадження m6A на місцях з'єднання зростає збільшує кінетику сплайсингу

Високий рівень m6A в інтронах пов'язаний з повільним та альтернативним зрощуванням

Резюме

Ефективність сплайсингу різниться залежно від транскриптів, і жорсткий контроль кінетики сплайсингу має вирішальне значення для скоординованої експресії генів. N-6-метиладенозин (m6A) є найпоширенішою модифікацією РНК і бере участь у регуляції біогенезу та функції РНК. Вплив m6A на регуляцію кінетики сплайсингу РНК невідомий. Тут ми пропонуємо врегульовану оцінку m6A з високою роздільною здатністю на зароджуваних транскриптах РНК та розкриваємо її значення для контролю кінетики сплайсингу РНК. Ми виявили, що раннє ко-транскрипційне осадження m6A поблизу з'єднань сплайсингу сприяє швидкому зрощуванню, тоді як модифікації m6A в інтронах пов'язані з довгими, повільно обробленими інтронами та альтернативними подіями сплайсингу. На закінчення ми показуємо, що раннє осадження m6A визначає долю розшифровок щодо кінетики сплайсингу та альтернативного сплайсингу.

Графічний реферат

транскриптома
  1. Завантажити: Завантажити зображення з високою роздільною здатністю (145 КБ)
  2. Завантажити: Завантажте повнорозмірне зображення

Попередній стаття у випуску Далі стаття у випуску