Ефективність росту та пристосованість мікробіоти кишечника морського окуня (Dicentrarchus labrax) до альтернативних дієт без рибних продуктів

Профілі препаратів кормів для риб, що використовуються в цьому дослідженні. Інгредієнти, що містяться в коробках, показують експериментальні корми, в яких 15% корму VEG замінено альтернативними джерелами білків. COM: Європейський комерційний корм зі звичайними продуктами тваринного походження. VEG: рослинний корм, що складається виключно з наземних рослинних продуктів та побічних продуктів. PAP: оброблений тваринний білок, що складається з суміші крови з птиці та гідролізованого пір’я птиці. INS: гідролізована мука для комах (Hermetia illucens). ТАК: дріжджовий шрот Saccharomyces cerevisiae. SPI: ціанобактерія (Arthrospira platensis). VEG олія: ріпакова олія. Усі дієти, крім СОМ, були збагачені олією мононенасичених жирних кислот (MUFA) з морських мікроводоростей (Schizochytrium sp). Зображення праворуч показують колір експериментальних гранул.

Еволюція міченого приросту маси тіла риб відповідно до використовуваних експериментальних дієт. Опис дієти див. На рисунку 1. Вага тіла для кожної дієти представлена як середнє значення ± стандартна помилка (n = 159 для кожної дієти, крім COM з n = 53).

(A) Коефіцієнт перетворення їжі (FCR) та (B) Вживання корму (FI) риби відповідно до використовуваних експериментальних дієт. COM (звичайний контроль комерційного корму), INS (85% VEG + 15% комах), PAP (85% VEG + 15% птиці і перо), SPI (85% VEG + 15% ціанобактерій), VEG (100% наземних рослин ) та YEA (85% VEG + 15% дріжджів), представлені як середнє значення ± стандартна помилка (n = 3 для кожної дієти, крім COM (n = 1)).

Міри мікробного α-різноманіття ((A): багатство OTU та (B): індекс Шеннона) в кишечнику морського окуня (n = 12-16 риб/дієта).

Відносна кількість (22) 22 типів, виявлених у всіх зразках різних дієтичних груп, свідчить про високу мінливість мікробіому кишечника серед окремих риб, що харчуються різними дієтами (n = 12-16 риб/дієта). Вгорі: рецептури кормів для риби, що використовуються у цьому дослідженні: COM (звичайний контроль комерційного корму), INS (85% VEG + 15% комах), PAP (85% VEG + 15% птиці та перу), SPI (85% VEG + 15 % ціанобактерій), VEG (100% наземних рослин) та YEA (85% VEG + 15% дріжджів).

Неметричні багатовимірні графіки масштабування, засновані на відмінностях Брея – Кертіса, що показують ординацію між кишковим бактеріальним співтовариством європейських морських окунів, що харчуються експериментальними дієтами (A) та типом зразка (B) наприкінці випробування на годування (t = 93 дні). Кожна крапка представляє окрему ділянку вибірки відповідно до її мікробного профілю на рівні OTU (n = 12-16 риб/дієта) .Вгорі праворуч: рецептури корму для риби, використані в цьому дослідженні: COM (звичайний комерційний контроль корму), INS (85% VEG + 15% комах), PAP (85% VEG + 15% птиці та перо), SPI (85% VEG + 15% ціанобактерій), VEG (100% наземних рослин) та YEA (85% VEG + 15% дріжджів) ).

Анотація

1. Вступ

2. Матеріали та методи

2.1. Етична заява

2.2. Формування та годівля кормів

2.3. Риба та умови експерименту

2.4. Методи засвоюваності

2.5. Вибірка вмісту шлунково-кишкового тракту

2.6. Екстракція ДНК та секвенування та аналіз генів 16S рРНК

2.7. Біоінформаційний та біостатистичний аналізи наборів даних мікробіоти

2.8. Статистичний аналіз показників маси тіла

N (0; σ 2 r), член Tk - це фіксований ефект часового кроку k, Iik - ефект взаємодії дієти i за часовим кроком k, а εijk - залишковий (εijk ∼ N (0; σ 2 e)) . Наступна модель ANOVA була використана для вивчення споживання корму, коефіцієнта перетворення корму та засвоюваності: