Дайджест мікробіомів - Вибір Біка

Щоденний дайджест наукових статей з мікробіомів, команда лікарів. Заснована Елізабет Бік, консультантом з мікробіомів та наукової цілісності. Twitter: @microbiomdigest

Блоги від ВСС сьогодні, коли я їду до Ванкувера. Мікроби в ротовій порожнині корелювали з мігренями, спричиненими їжею, пошкодженнями спинного мозку, порівнянням 8 наборів для вилучення ДНК на 3 типах зразків, mockrobiota.

Робота та заходи

Літаємо сьогодні до Ванкуверу, щоб провести коротку бесіду на сесії сніданку Microbiome DNA від Genotek на # ASHG2016

Ротовий мікробіом людини

Мікробіом шкіри людини

Тваринні моделі

Дисбіоз кишечника погіршує відновлення після травми спинного мозку - Крістіна А. Кігерль - журнал експериментальної медицини

Прийоми

Біоінформатика та метагеноміка

Мікроби в новинах

Мікроби та гроші

Вагінальні пробіотики, судово-медичний аналіз шкірних бактерій на тканинах, вольбахія у нематод, філосфера плюща, життя мікробів у двох полярних крайнощах, як поліпшити середовище в приміщенні та аналіз масових специфікацій молекул середовища існування людини.

Вагітність і раннє життя

Загальний мікробіом людини

Огляд: Невідповідність здоров’я та мікробіом - Кейша Фіндлі - Тенденції мікробіології

Дихальний мікробіом людини

Мікробіом шкіри та тканини людини

Ні слова про контроль екстракції, тому діяйте обережно: Бактеріальні спільноти, пов’язані з атеросклеротичними бляшками у росіян, хворих на атеросклероз - Ельвіра Е. Зіганшина - PLOS ONE

Мікробіом кишечника людини

Огляд: Мікробіота кишечника та шлунково-кишкова хірургія - Крістіна Гайтон - Відгуки про природу Гастроентерологія та гепатологія

Огляд: Мікробіота кишечника та ризик розвитку целіакії - Cenit, Maria C. - Журнал клінічної гастроентерології

Редакційна стаття: Що у вашому мікробіометрії? - Мартін Х. Флох - журнал клінічної гастроентерології

Моделі на тваринах та in vitro

Тваринний мікробіом

Мікробіом рослин, коренів та грунту

Вода та екстремофільний мікробіом

Вбудований мікробіом середовища

Харчова мікробіологія

Біоінформатика та метагеноміка

Мікроби в новинах

Істерія бактерій

Наука, видавнича справа та кар’єра

Фекальні маркери на руках у дітей в Бангладеш, Clostridium difficile у домашніх собак, припливні мікроби та мінливість домашніх бактерій у повітрі.

Мікробіом шкіри людини

Дихальний мікробіом людини

Сечовивідні та репродуктивні шляхи людини

Лише методи, результатів немає (або: як написати дві статті замість однієї): Методологія дослідження вагінального та сечового мікробіомів у жінок зі змішаним нетриманням сечі - Юко М. Комесу - Міжнародний журнал з урогінекології

Ротовий мікробіом людини

Мікробіом кишечника людини

Експерименти на тваринах

Тваринний мікробіом

Мікробіом рослин, коренів та грунту

Вбудований мікробіом середовища

Мікроби в новинах

Бактерії в ранах, оксалобактери та камені в нирках, морські котики, соболі, п'явки, відповідь на залісення, підльодовикове озеро, забруднена річкова вода.

Мікробіом шкіри та рани людини

Мікробіом кишечника людини

Експерименти на тваринах та інші

Тваринний мікробіом

Мікробіом рослин, коренів та грунту

Вода та екстремофільний мікробіом

Вбудований мікробіом середовища

Мікробіологія відходів та забруднення

Біоінформатика та метагеноміка

Мікроби в новинах

Мікробіом на лобковому волоссі, трансплантат легенів virome, підпис мікробіома IBS, копроліти, антибактеріальні молекули для немовлят сумка з тасманійським дияволом, моделювання Archaea in Mars, білий пудинг, функціональне картографування,

Ротовий мікробіом людини

Дихальний мікробіом людини

Мікробіом шкіри та волосся людини

Огляд: Мікробіом у здоровій шкірі, оновлення для дерматологів - Б. Дрено - журнал Європейської академії дерматології та венерології

Мікробіом репродуктивного тракту людини

Мікробіом кишечника людини

Огляд: мікробіота кишечника та шлунково-кишкова хірургія - Крістіна Гайтон - Відгуки про природу Гастроентерологія та гепатологія

Огляд: Паразити, мікробіоти та метаболічні захворювання - Sonakshi Bhattacharjee - Імунологія паразитів

Тваринні моделі

Тваринний мікробіом

Мікробіом рослин, коренів та грунту

Мікробіом води

Мікроби в космосі

Харчова мікробіологія

Мікробіологія побудованого середовища

Техніка/Гриби

Біоінформатика та метагеноміка

Мікроби в новинах

Наука, видавнича справа та кар’єра

Дослідження етики та мікробіомів, спрощення досліджень мікробіомів, віруси знищують археї в глибокому морському дні, Clostridium difficile у пацієнтів, які діляться на лікарняних ліжках.

Загальний мікробіом

Мікробіом кишечника людини

Тваринні моделі

Мікробіом рослин, коренів та грунту

Мікробіологія води (і коралів)

Харчова мікробіологія

Прийоми

Метагеноміка

Інша мікробіологія

Мікроби в новинах

Серія розмовних кишок:

Наука, видавнича справа та кар’єра

Немікробіологічні вибори Біка

Оскільки стільки великих університетів Бей-Бей і компаній, що займаються наукою про життя, працюють над людським мікробіомом та іншими мікробіологічними спільнотами, ми, четверо (див. Нижче), вважали, що має сенс організувати “Мікробіом-зустріч Бей-Бей”. Це буде - сподіваємось! - розпочати серію зустрічей для зв’язку, обговорення та обміну інформацією про останні дослідження мікробіомів.

IndieBio, біотехнологічний прискорювач, розташований у Сан-Франциско, люб’язно запропонував провести захід у понеділок, 7 листопада 2016 року, з 6 до 9 вечора. Тема цього вечора буде "Комерціалізація мікробіома"

Головною метою нашої першої події буде знайомство між собою. Ми приймемо професіоналів з мікробіомів з провідних дослідницьких установ району Бей (наприклад, UCSF, UC Berkeley, UC Davis та Stanford), а також передових наукових організацій з питань біології та біотехнологій.

Ми розпочнемо вечір із серії коротких тем, представлених представниками декількох мікробіологічних компаній Bay Area та стартапами, після чого буде проведена панель запитань. Але більшу частину вечора буде міксер у неформальній обстановці з їжею та напоями. Це буде чудова можливість зміцнити зв’язок між вченими мікробіомів, що працюють в академічних колах та біотехнологіях, а також навчитися, спілкуватися та створювати мережі.

Захід буде безкоштовним, напої та легка їжа будуть забезпечені завдяки щедрим пожертвам Другого Геному, Асамблеї Biosciences, One Codex, uBiome, Whole Biome, Osel Inc та нашого ведучого IndieBio. Кількість місць обмежена.

Ось флаєр, який можна переслати іншим людям, яким це може бути цікаво: листопад-microbiome-meetup-v4 (PDF).

Ми сподіваємось, що ця зустріч Microbiome матиме великий успіх!

Jun Axup, IndieBio (наш ведучий)
Стівен Мартіс, UC Берклі (дизайн плаката)
Джордж Рош, UC Берклі
Елізабет Бік, Стенфордський університет

Немовлята з бронхіолітом, дослідження рецептора вітаміну D GWAS, довгострокові ефекти трансплантації стільця, зменшення геному в ендосимбіонтах комах, дентрифікуючі спільноти затоки Сан-Франциско, резистоми в метагеномних наборах даних, Picodroplet WGA для метагеноміки.

Робота та заходи

Вагітність і раннє життя

Загальний і багатосайтовий мікробіом людини

Ротовий мікробіом людини

Дихальний мікробіом людини

Мікробіом сечовивідних шляхів людини

Мікробіом репродуктивного тракту людини