Відділ лімфатичних вузлів, що розділений, диктує адаптаційні імунні реакції кишечника

Анотація

Основна функція кишечника полягає в перетравленні та засвоєнні харчових поживних речовин за допомогою абсорбційного епітелію та судинної системи судин і лімфатичної системи, а також мікробіома 6. Відбір поживних речовин та абсорбційна здатність змінюються по кишечнику; більшість харчових поживних речовин поглинається ворсинками верхньої частини тонкої кишки (дванадцятипала кишка (D) і тонка кишка (J)) і меншою мірою нижньою частиною тонкої кишки (клубова кишка, I), тоді як щільна мікробіота в I і товстій кишці ( В) опосередковує подальше виділення поживних речовин. У кишечнику також знаходиться найбільший імунний відсік в організмі, якому покладено завдання забезпечити стійкість до токсинів та вторгнення патогенних мікроорганізмів, зберігаючи при цьому толерантність до дієтичних та мікробіотичних антигенів, або за допомогою місцевої дії, або за допомогою лімфатичного трафіку до стікаючих кишечнику млМН для реалізації адаптивних реакцій, 9. Ми прагнули зрозуміти, як компартменталізований лімфодренаж кишечника сприяє організованій імунній відповіді в цьому складному середовищі.

відділення

Наші дані розкривають механізм, за допомогою якого кишкова імунна система одночасно обробляє регуляторну та протизапальну реакції: шляхом анатомічного розділення цих реакцій на різні, функціонально спеціалізовані млН. Ефективний дренаж дієтичних антигенів у лімфатичні вузли, що сприяють толерантності, пов’язані з проксимальним відділом кишечника, сприяє розумінню питань профілактики харчової алергії, а також пов’язують дуоденальну інфекцію та дисбіоз як порушення навколишнього середовища, які можуть змінити алергічний результат. Цілком імовірно, що пероральна вакцинація, як правило, викликає зниження імунної відповіді 30 за цим самим механізмом. Однак толерогенний шлях дванадцятипалої кишки може бути використаний терапевтично для індукції толерантності до недоступних інакше джерел протизапального антигену, таких як дисбіотична клубова кишка або бактерії товстої кишки при запальних захворюваннях кишечника.

Методи

Самки щурів вістар 6-10 тижнів були придбані у річки Чарльз. Догляд за тваринами та експериментування відповідали керівним принципам NIH і були схвалені Інституційним комітетом з догляду та використання тварин при Рокфеллерівському університеті.

Реагенти

Наступні реагенти були придбані у Sigma: бензиловий ефір (108014), дихлорметан (270997), Fast Green FCF (F7252), гепарин (H3393), омепразол (O104), Pluronic L-81 (435430), пірантел памоат (P6210) Овальбумін (ступінь VI, A2512; ступінь III A5378) та ванкоміцин (V2002). Овалбумін без LPS був з Гіглосу, Німеччина (Кат. № 77161). 3 H-ретинол і Na 125 I були від Перкіна-Елмера.

Антитіла, фарбування та проточна цитометрія

Очищення тканин, мікроскопія світлового аркуша та реконструкція зображень

Що стосується очищення та фарбування тканин, протоколу iDISCO було дотримано, як описано на веб-сайті, що постійно оновлюється: http://idisco.info із наступними особливостями: Тканини фарбувались у первинних та вторинних антитілах протягом 4 днів кожна і були вбудовані в 1 % агарози-TAE до остаточної дегідратації. Блоки знімали за допомогою LaVision Ultramicroscope II та програмного забезпечення. Зображення реконструювали за допомогою програмного забезпечення Imaris 8.

3 Біорозподіл H-ретинолу

Мишей голодували протягом 3 годин перед введенням 150 мкл PBS з або без 5 мкл утворення хіломікрону, що інгібує Pluronic L-81, після чого 1 мкСі 3 H-ретинол у 100 мкл оливкової олії через 30 хвилин і відбирали проби у зазначені моменти часу. Сироватка бралася з підщелепної вени (системної) або з ворітної вени. Лімфу збирали з грудної протоки під наркозом ізофлурану за допомогою виготовленої на замовлення скляної голки (знімач мікропіпетки, Sutter Instrument). Розсічені органи зважували до лізису шляхом механічного порушення в 0,5 мл гіпертонічному буфері лізису з 1% Triton-X 100, лізаті, змішаному з 7 мл сцинтиляційного коктейлю Ultima Gold (Perkin Elmer), та накопиченню радіоактивності, виміряної на сцинтиляційному лічильнику. Вхідну радіоактивність оцінювали, підраховуючи 10% матеріалу, що потрапляє під всмоктування.

Сегментація брижових лімфатичних вузлів

Мезентеріальні лімфатичні вузли, що дренують кишкові сегменти, анатомічно визначали, простежуючи лімфатичні судини, що з’єднують товсту кишку, клубову кишку і тонку кишку з їх лімфатичними вузлами. Дуоденальні лімфатичні вузли були виявлені шляхом видалення 100 мкл оливкової олії (Sigma) та визначення найбільш проксимальних лімфатичних вузлів шлунка, оточених хілером, що свідчить про дренаж дванадцятипалої кишки, через 1 годину після забору.

Виділення лімфоцитів та АРС з лімфатичних вузлів

Тканини розсікали на холодний HBSS, додавали Mg 2+ і Ca 2+, дрібно подрібнювали та інкубували в 400 U/мл колагенази D (Roche) в HBSS протягом 25 хв при 37 ° C, 5% CO2. Колагеназу гасили на льоду додаванням остаточних 10% FCS. Одноклітинні суспензії витягували із сполучної тканини шляхом прийому та ресуспендування дайджестів п’ять разів. Еритроцити лізували інкубацією в буфері лізису еритроцитів (Sigma) протягом 7 хв при RT.

Виділення лімфоцитів та APC з тонкої та товстої кишок

Виділення клітин для РНК-послідовності

Клітини сортували за допомогою проточного цитометра FACS Aria для сортування клітин (Becton Dickinson). Дендритні клітини MLN попередньо збагачували за допомогою набору для ізоляції пандеритних клітин (130-100-875, Miltenyi Biotec) та колонок розділення LS MACS (Miltenyi Biotec). 14-тижневі чоловіки C57BL/6 служили донорами mLN, і були зібрані біологічні тричі або чотириразові повтори. Дендритні клітини сортували як Aqua - CD45 + Lin - (CD3 - B220 - NK1.1 - CD19 -) CD11c hi, а субпопуляції далі як MHCII hi CD103 + CD11b - та MHCII hi CD103 + CD11b +. Триста клітин сортували безпосередньо в 25 мкл буфера TCL (Qiagen, 1031576), доповненого 1% β-меркаптоетанолом з точністю до однієї клітини. Зразки витримували при кімнатній температурі протягом 5 хв, віджимали і витримували при - 80 °З до подальшої обробки.

Підготовка та послідовність бібліотек RNA-seq

Аналіз даних RNA-seq

Був перевірений рівний внесок зразків у показники. Необроблені показники вирівнювали за допомогою Каллісто, а диференціальний вираз проводили за допомогою DESeq2. Значення р 0,05 було використано як граничне значення для визначення диференційовано експресованих генів, виділених на ділянках вулканів. Ділянки PCA та ділянки вулканів були згенеровані в R. Складений ранжирований файл був створений на основі змін log2-кратного розміру і згодом запущений як аналіз GSEA Preranked (GSEA v3.0) з c5.all.v6.1.symbols.gmt (Онтологія генів ) база даних набору генів. Всі шляхи з коефіцієнтом помилкового виявлення (FDR) 0,25 або менше вважалися суттєво різними між зразками.

Аналіз активності RALDH

Активність RALDH визначали за допомогою набору Aldefluor (STEMCELL TM Technologies) відповідно до протоколу виробника.

125 Маркування I-OVA та біорозподіл

Йодування ОВА проводили, як описано раніше 14. Мишей голодували протягом 3 год перед проведенням зонду 4 x 10 6 CPM 125 I-OVA та 50 мг холодного OVA (ступінь III) у 200 мкл PBS, а проби відбирали через 1 год та 5 год після пробірки. Перед вимірюванням радіоактивності на гамма-лічильнику (Packard Cobra) брали вологу вагу тканин. Вхідну радіоактивність оцінювали шляхом підрахунку 10% матеріалу, що потрапляє під всмоктування.

Адоптивний передача Т-клітин

Наївні CD4-Т-клітини із селезінки та лімфатичних вузлів були виділені негативним відбором із використанням біотинільованих антитіл проти CD8α, CD25, CD11c, CD11b, TER-119, NK1.1 та B220 та бісерних бісерних MACS (Miltenyi Biotec). Чистоту трансгенних CD4 + Т-клітин перевіряли за допомогою проточної цитометрії (CD45.1 + Vα2 + Vβ5 + CD25 - для клітин OT-II, CD45.1 CD45.1 + Vβ14 + CD25 - для клітин 7B8tg, зазвичай> 90%). Т-клітини мітили за допомогою Cell Trace TM Violet або CFSE Cell Proliferation Kit (Life Technologies). Для клітин OT-II 2 × 10 6 переносили шляхом ретро-орбітальної ін’єкції під газовою анестезією на ізофлуран. Для клітин 7B8tg 4 х 105 клітин переносили для аналізу mLNs через 60 годин після перенесення та 5000 клітин для аналізу через 7 днів або більше після перенесення в кишечник та mLNs.

Пероральне введення антигену

OVA (ступінь III, Sigma, A5378) вводили по 50 мг у 200 мкл PBS пероральним введенням з використанням металевих голкових голок. Були введені дві дози з інтервалом у 24 години. SFB-пептид FSGAVPNKTD (виготовлений на замовлення за допомогою N-кінцевого ацетилювання, LifeTein, LLC.) Вводили у вигляді 1 мг або 5 мг у 200 мкл PBS шляхом перорального введення через внутрішньовенне введення. лікування інгібітором протонної помпи 1 мг омепразолом (у 200 мкл PBS, 1% Твін 80), що проводиться за 24 год 15 хв до введення, щоб зменшити травлення пептиду в шлунку. Контрольним мишам давали лише омепразол.

Проходження і зараження S. venezuelensis

S.venezuelensis підтримувався у щурів Wistar шляхом підшкірної інфекції 30000 личинок. 6-8 день п.і. сліпа кишка, що містить яйця, збирали і викладали на ватман, який поміщали у склянку з водою при 28 ° C. Личинок, що виводяться, збирали протягом 4 днів і цикл відновлювали. Мишей заражали підшкірно 700 личинками/мишами. Навантаження глистів дорослих оцінювали в загальних епітеліальних подряпинах кишечника.

Імунізація квасцов та виклик дихальних шляхів

Через сім днів після перорального введення OVA 4 мкг без ендотоксину OVA антигену, адсорбованого до 40 мкл ад'юванту галун Imject ™ (галузь Fisher Scientific), вводили внутрішньовенно. в кінцевому обсязі 400 мкл, доповненого PBS. Імунізацію повторювали через 7 днів. Щоб викликати запалення дихальних шляхів, мишам знеболювали і інтраназально вводили 10 мкг стерильного OVA ступеня VI у 50 мкл PBS (25 мкл на ніздрю) на 14, 17 та 21 день після першого внутрішньовенного введення. імунізація. Загальний IgE вимірювали для підтвердження попередньої інфекції S. venezuelensis (250-350 нг/мл у плазмі порівняно з 5-10 нг у плазмі неінфікованих мишей) 14 .

Бронхоальвеолярний лаваж (BAL), гістологія легенів та аналіз інфільтрату методом проточної цитометрії

Мишей знеболювали i.p. вводячи 0,35 мл 2,5% авертину (Sigma), трахею канюлювали, а легені промивали один раз 0,5 мл, а потім 1,0 мл PBS. Загальний вміст клітин BAL підраховували після лізису еритроцитів і фарбували для аналізу FACS. Легкі перфузували через правий шлуночок 10 мл фізіологічного розчину для промивання залишкової крові. Одну часточку перетравлювали в 400 ОД/мл колагенази D/HBSS і обробляли для аналізу FACS. Еозинофіли визначали як CD45 + SSA hi MHCII - CD11b + Ly6G int SiglecF +, нейтрофіли як CD45 + SSA hi MHCII - CD11b + Ly6G hi SiglecF -, а DC як CD45 + MHCII + CD11c + CD64 - SiglecF - .

Імуноферментні аналізи IgG1 проти OVA та загальні IgE

ІФА проводили, як описано раніше 14 .

Колонізація та виснаження SFB

SFB отримували із заморожених запасів цекального вмісту (витримували при -80 ° C менше 6 місяців) мишей, моноколонізованих SFB, яких розбавляли в PBS (2 мл/сліпа кишка) і пропускали через сітку 70 мкм. Мишей колонізували двома датчиками по 0,4 мл препарату без сліпої кишки, через 24 години. Для виснаження SFB мишей обробляли 200 мкл 10 мг/мл ванкоміцину за 10, 9 та 8 днів до адоптивного переносу клітин 7B8, і клітини обмінювали щоразу, щоб мінімізувати повторну колонізацію залишковим SFB у фекаліях. Колонізація або виснаження було перевірено за допомогою ПЛР в реальному часі фекальної ДНК (набір Quickpre DNA Fecal/Soil micropre miniprep, дослідження Zymo, кат. № D6010). ПЛР проводили в присутності Power SYBR Green PCR master mix (Applied Biosystems, 4367659) на машині Quant Studio 3 PCR (Applied Biosystems), використовуючи специфічні для SFB праймери 16S (fwd: GACGCTGAGGCATGAGAGCAT, rev: GACGGCACGGATTGTTATTCA). за допомогою Ct, отриманого в ПЛР з використанням універсальних бактеріальних праймерів 16S (fwd: ACTCCTACGGGAGGCAGCAGT, rev: ATTACCGCGGCTGCTGGC).

Хірургія лімфатичних вузлів

Швидке відстеження зеленого кольору

Мишам знеболювали ізофлураном і оголювали порожнину очеревини. 3-5 мкл 10% Fast Green у PBS вводили в м’язи кінцевої клубової кишки за допомогою наноін’єкційного пристрою (Nanoject III, Drummond). Поширення зеленого кольору по лімфатичній системі спостерігалося доти, поки він не накопичувався в зливному відділі клубової лімфатичного вузла, і поки він знову не зів'янув (підроблені миші) і не дійшов до просвіту дванадцятипалої кишки через жовчну протоку, не довше 15 хвилин. Ті самі терміни застосовувались у мишей, у яких було видалено млN клубової та сліпої кишок, хоча барвник ніколи не накопичувався в лімфовузлі.

Статистичний аналіз

Статистичний аналіз проводили в програмі GraphPad Prism 7.0. Багатофакторні дані аналізували, застосовуючи односторонній ANOVA та багаторазовий порівняльний тест Tukey post hoc, порівняння між двома умовами лікування за допомогою однобічного непарного t-тесту Стьюдента. Значення Р менше 0,05 вважалося значущим.

Внески автора

Д.Е. ініціював, спроектував, виконав та проаналізував дослідження та написав роботу. M.C.C.C. розроблені та виконані дослідження інфекції та хірургії. Л.М. виконував сортування постійного струму та керував підготовкою бібліотеки RNA-seq, П.А.М. виконано вирівнювання та аналіз даних RNA-seq та швидке зелене введення. А.Л. проводив радіоактивні дослідження. A.M.C.F започаткував модель S. venezuelensis та зробив внесок у експериментальний дизайн, використовуючи модель. Всі автори редагували статтю. Д.М. ініціював, розробляв та контролював дослідження та написав роботу.

Конкуруючі інтереси

Автори заявляють про відсутність конкуруючих фінансових інтересів.

Матеріали та листування

Дарія Естерхазі (desterhazyrockefeller.edu) або Даніель Мусіда (mucidarockefeller.edu)

Розширені легенди рисунка

Розширена Фігура 1. Розширена характеристика організації лімфатичної системи кишкової імунної системи та всмоктування ретинолу в їжу.