Упередження щодо ідентифікації грибків у проектах мікробіомів

Музей природознавства, Тартуський університет, Равіла 14а, Тарту, 50411, Естонія

грибків

Для листування. Електронна пошта [email protected]; Тел. (+372) 56654986; Факс (+372) 7376222. Шукайте інші статті цього автора

Кафедра ґрунту та навколишнього середовища, Шведський університет сільськогосподарських наук, Box 7014, Упсала, SE, 75007 Швеція

Музей природознавства, Тартуський університет, Равіла 14а, Тарту, 50411, Естонія

Для листування. Електронна пошта [email protected]; Тел. (+372) 56654986; Факс (+372) 7376222. Шукайте інші статті цього автора

Кафедра ґрунту та навколишнього середовища, Шведський університет сільськогосподарських наук, Box 7014, Упсала, SE, 75007 Швеція

Резюме

Гриби є ключовими гравцями в екосистемах, а також у здоров’ї рослин і людей. Високопродуктивна молекулярна ідентифікація грибів значно покращила наше розуміння різноманіття мутуалістів, сапротрофів та патогенів. Ми стверджуємо, що методи, просунуті консорціумами мікробіомів, є неоптимальними для виявлення найважливіших грибкових патогенів та екологічно важливих деградерів. Ми рекомендуємо кілька наборів оптимізованих праймерів для аналізу грибів або всіх груп еукаріотів на основі коротких або довгих ампліконів, які охоплюють область ITS, а також частину 18S та 28S рДНК.