Профілі ліпідів та жирних кислот Pseudomonas aurantiaca Зв’язані з ДНК ліпіди визначають за допомогою мас-спектрометрії

Анотація

Підхід, використаний для дослідження складу ліпідів вільно (фракція 1) і щільно (фракція 2) ДНК-зв'язаних ліпідів Pseudomonas aurantiaca клітин методом електророзпилювальної іонізації з використанням мас-спектрометрії (ESI-LC-MS) використовували для визначення ліпідома прокаріотичної клітини. Були виявлені вільні жирні кислоти C16: 0, C18: 1 (фракція 1), C14: 0, C16: 0 та C18: 2 (фракція 2). Обидві фракції зв’язаних з ДНК ліпідів характеризувались наявністю фосфатидилгліцерину, фосфатидилсерину та лізо-фосфатидилінозитолу. Розчинна у спирті фракція 1 може також містити фосфатидилхолін та фосфатидилінозитол, тоді як фракція 2, ймовірно, містила триацилгліцериди. Порівняно з газовою хроматографією, ESI-LC-MS забезпечує нові можливості для дослідження нуклеоїдного ліпідома, що дозволяє більш детально досліджувати зв’язані з ДНК ліпіди в бактеріальних клітинах.

Це попередній перегляд вмісту передплати, увійдіть, щоб перевірити доступ.

Параметри доступу

Придбайте одну статтю

Миттєвий доступ до повної статті PDF.

Розрахунок податку буде завершено під час оформлення замовлення.

Список літератури

Іванова П., Мілн С., Бірн М.О. Ідентифікація та кількісне визначення гліцерофосфоліпідів за допомогою електророзпилювальної мас-спектрометрії, Методи Ензимол., 2007, вип. 432, с. 21–57.

Бішофф, Г. та Жданов, Р. І. Ліпідомія - ліпіди беруть участь у складності геному людини, Хім. Інген. Тех. 2002, вип. 74, ні. 5, с. 714.

Лагард, М., Гелоен, А., Рекорд, М., Венс, Д. та Спеннер, Ф., з’являється ліпідоміка, Біохім. Біофіза. Acta, 2003, вип. 1634, с. 61.

Венк, М.Р., Нова ліпідомічна сфера, Nature Rev., 2005, вип. 4, с. 594–610.

Жданов, Р.І., Салафутдінов, І.І., Арслан, А., та Ібрагімова, М.Я., Новий маркер профілю FAME Pseudomonas aurantiaca загальні ліпіди, Доклади Біохім. Біофіза., 2012, вип. 445, ні. 1, с. 183–186.

Тарасов, Д.С., Ібрагімова, М.Я., Ізотова, Є.Д., Акберова, Н.І. та Жданов Р.І., Молекулярна динаміка та вільна енергія зв'язування олеїнової кислоти з ДНК у водних розчинах, Доклади Біохім. Біофіза., 2012, вип. 446, ні. 2, с. 223–228.

Жданов Р.І., Крилов А.С., Зарубіна Т.В., Бішоф Г.Г. та Ібрагімова М.Ю. Комплексація між ДНК та кардіоліпіном за даними спектрофотометрії та кругового дихроїзму, Доклади Біохім. Біофіза., 2013, вип. 453, ні. 3, с. 290–294.

Carvalho, M., Sampaio, J.L., Palm, W., Brankatschk, M., Eaton, S., and Shevchenko, A., Effects of diet and development on the Дрозофіла ліпідом, J. Mol. Сист. Біол., 2012, вип. 8, № 1, с. 600–605.

Стручков В.А., Стражевська Н.Б. та Жданов Р.І. Специфічні природні ДНК-пов'язані ліпіди в епоху постгеному. Ліпідна концепція організації хроматину, Біоелектрохім., 2002, вип. 56, С. 195–198.

Стручков В.А., Стражевська Н.Б. та Жданов Р.І. ДНК-пов'язані ліпіди нормальних та пухлинних клітин: ретроспектива та перспективи функціональної геноміки та ліпід-ДНК-коду, Біоелектрохім., 2002, вип. 58, с. 23–31.

Альбі, Е. та Віола Магні, М.П., Роль внутрішньоядерних ліпідів, Біол. Клітинка., 2004, вип. 96, ні. 8, с. 657–667.

Ханун, Ю.А. та Obeid, L.M., Принципи біоактивної ліпідної сигналізації: уроки від сфінголіпідів, Нат. Преподобний Мол. Клітинна біол., 2008, вип. 9, № 2, с. 139–150.

Jump, D.B., Регулювання жирної кислоти транскрипції генів, Крит. Преподобний Клін. Лабораторія. Наук., 2004, вип. 41, No 1, с. 41–78.

Жданов Р.І., Стражевська Н.Б., Жданов А.Р. та Бішофф Г., J. Biomol. Вул. Dyn., 2002, вип. 20, № 2, с. 231–241.

Жданов Р.І., Бішофф Г. та Ібрагімова М.Ю. Про зв'язок ДНК-полінуклеотидів з кардіоліпіном, Уч. Зап. Казань. Ун-т. Сер. Нат. Наук., 2012, вип. 154, ні. 4, с. 164–174.

Жданов Р.І., Стручков В.А., Дьябіна О.В. та Стражевська Н.Б. Хроматин-зв’язаний кардіоліпін: фосфоліпід проліфареції, Цитобіос, 2001, вип. 106, с. 55–61.

Жданов Р.І., Шмиріна А.С., Зарубіна Т.В., Краус А. та Лоренц В.Профіли жирних кислот зв'язаних з ДНК і цільноклітинних ліпідів Pseudomonas aurantiaca різко відрізняються, Доклади Біохім. Біофіза., 2006, вип. 410, No 4, с. 292–296.

Жданов Р.І., Шмиріна А.С., Мулюкін А.Л., Ель’Регістан, Г.І., Зарубіна Т.В., Краус А., Хаупт Н., та Лоренц В., Доклади Біохім. Біофіза., 2006, вип. 410, No 6, с. 320–323.

Жданов Р., Шмиріна А., Зарубіна Т., Мулюкін А., Ель-Регістан, Г., Хаупт Н., Краус А. та Лоренц В. P. aurantiaca Зв’язані з ДНК ліпіди, FEMS мікробіол. Lett. 2006, вип. 265, с. 151–158.

Жданов Р.І. Курбанов Р.А. та Ібрагімова М.Ю. патент РФ RU 2506314, 2013 р.

Стручков, В.А. та Стражевська, Н.Б., зв’язані з ДНК ліпіди: склад та можлива функція, Біохімія, 1993, вип. 58, ні. 8, с. 1154–1175.

Шепелєв А.П., Шестопалов А.В., Риндич А.А., Ставіський І.М. та Яговкіна В.В., пов'язані з ДНК ліпіди термостійких і термолабільних Шигелла соней штами, Бик. Експ. Біол. Мед., 1995, вип. 120, ні. 2, с. 332–333.

Мулюкін А. Pseudomo- nas aurantiaca ДНК та про індукцію фенотипової дисоціації, Мікробіологія (Москва). 2005, вип. 74, ні. 2, с. 128–135.

Стражевська, Н.Б., Мулюкін, А.Л., Шмиріна, А.С., Краус, А., Лоренц, В., Жданов, Р.І. та Ель’Регістан, Г.І., Характеристика Pseudomonas aurantiaca Надмолекулярні комплекси ДНК на різних стадіях розвитку, Мікробіологія (Москва), 2009, вип. 78, ні. 1, с. 48–55.

Жданов Р.І. та Ібрагімова М.Й. Новий інформаційний рівень геномної ДНК: ліпіди, специфічно зв’язані з ДНК, Генетика та хімія спільно з мовою відкриття: Серія клітинних симпозіумів, Бостон, 2013, с. 29.

Модер, М., Браун, П., Ланге, Ф., Шредер, С. та Лоренц, В., Визначення сполук, що руйнують ендокринну систему, та кислих препаратів у воді, шляхом сполучення дериватизації, газової хроматографії та негативно-хімічної іонізаційної мас-спектрометрії, Чистий ґрунт, повітря, вода, 2007, вип. 35, ні. 5, с. 444–451.

Abb, M., Heinrich, T., Sorkau, E., and Lorenz, W., Phthalates in house dust, Навколишнє середовище. Міжнародний., 2009, вип. 35, ні. 6, с. 965–970.

Ruiz N., Kane D., and Silhavy T.J., Досягнення у розумінні бактеріального біогенезу зовнішньої мембрани, Nature Rev. Microbiol. 2006, вип. 4, с. 57–66.

Д’ячков Є.П., Ібрагімова М.Ю., Д’ячков П.Н. та Жданов Р.І. Дослідження взаємодії ДНК з жирними кислотами за допомогою молекулярного стикування, Уч. Зап. Казань. Ун-т. Сер. Нат. Наук., 2011, вип. 153, ні. 1, с. 86–96.

Fuchs, B., Suess, R., і Schuller, Ju., Оновлення масової спектрометрії MALDI-TOF у дослідженнях ліпідів, Прогр. Ліпідний Res., 2010, вип. 49, с. 450–475.