Вплив конформації білка та стану протонування AMP на випромінювання біолюмінесцентних світляків
Представлення хімічних форм оксилуциферину, конформацій білка та станів протонування АМФ, розглянутих у цьому дослідженні.
Графічне зображення двох моделей водневих зв’язків, знайдених під час моделювання (кето-4G36-AMPH як репрезентативний випадок) між фенолятною частиною (O1) з (а) молекулами води (схема 1) або (b) ARG377 та молекулами води ( візерунок 2). (c) Імітовані спектри випромінювання для двох моделювань MD: імітація MD A кето-4G36-AMPH (червона лінія) характеризується схемою водневих зв'язків 1, а MD моделювання B кето-4G36-AMPH (чорна лінія) характеризується воднем -вик візерунка 2.
Графічне зображення моделей водневих зв’язків, знайдених під час моделювання (а) кето-4G36-AMPH та (b) кето-4G37-AMPH. (c) Гістограма, що показує кількість молекул води в межах 3 ангстремів O2 під час моделювання. (d) Імітовані спектри випромінювання для кето-4G36-AMPH та кето-4G37-AMPH.
Графічне зображення моделей водневих зв’язків, знайдених під час моделювання (а) кето-4G36-AMP та (b) кето-4G37-AMP. (c) Імітовані спектри випромінювання для кето-4G36-AMP та кето-4G37-AMP.
Графічне зображення моделей водневих зв’язків, знайдених під час моделювання (а) енол-4G36-AMPH за участю GLY341 та AMPH - (шаблон 1), (b) енол-4G36-AMPH, що включає лише AMPH - (шаблон 2) та (c ) енол-4G37-AMPH (малюнок 2). (d) Імітовані спектри випромінювання для енол-4G36-AMPH (червоний) та енол-4G37-AMPH (чорний).
Графічне зображення моделей водневих зв’язків, знайдених під час моделювання (а) енол-4G36-AMP та (b) енол-4G37-AMP. (c) Гістограма, що показує кількість молекул води в межах 3 ангстремів O2 під час моделювання. (d) Імітовані спектри випромінювання для enol-4G36-AMP та enol-4G37-AMP.
Імітовані спектри випромінювання, інтенсивність яких нормалізована з урахуванням найбільш інтенсивного спектру (enol-4G37-AMP) як еталонного значення 1, змінюючи конформацію білка та стан протонування AMP для (a) фенолат-кето та (b) фенолату енольні хімічні форми оксилуциферину.
Схематичне зображення біолюмінесцентної реакції світлячків, що показує першу (1) та другу (2) каталітичні реакції.
Анотація
Представлення хімічних форм оксилуциферину, конформацій білка та станів протонування АМФ, розглянутих у цьому дослідженні.
Графічне зображення двох моделей водневих зв’язків, знайдених під час моделювання (кето-4G36-AMPH як репрезентативний випадок) між фенолятною частиною (O1) з (а) молекулами води (схема 1) або (b) ARG377 та молекулами води ( візерунок 2). (c) Імітовані спектри випромінювання для двох моделювань MD: імітація MD A кето-4G36-AMPH (червона лінія) характеризується схемою водневих зв'язків 1, а MD моделювання B кето-4G36-AMPH (чорна лінія) характеризується воднем -схема зв’язку 2.
Графічне зображення моделей водневих зв’язків, знайдених під час моделювання (а) кето-4G36-AMPH та (b) кето-4G37-AMPH. (c) Гістограма, що показує кількість молекул води в межах 3 ангстремів O2 під час моделювання. (d) Імітовані спектри випромінювання для кето-4G36-AMPH та кето-4G37-AMPH.
Графічне зображення моделей водневих зв’язків, знайдених під час моделювання (а) кето-4G36-AMP та (b) кето-4G37-AMP. (c) Імітовані спектри випромінювання для кето-4G36-AMP та кето-4G37-AMP.
Графічне зображення моделей водневих зв’язків, знайдених під час моделювання (а) енол-4G36-AMPH за участю GLY341 та AMPH - (шаблон 1), (b) енол-4G36-AMPH, що включає лише AMPH - (шаблон 2) та (c ) енол-4G37-AMPH (малюнок 2). (d) Імітовані спектри випромінювання для енол-4G36-AMPH (червоний) та енол-4G37-AMPH (чорний).
Графічне зображення моделей водневих зв’язків, знайдених під час моделювання (а) енол-4G36-AMP та (b) енол-4G37-AMP. (c) Гістограма, що показує кількість молекул води в межах 3 ангстремів O2 під час моделювання. (d) Імітовані спектри випромінювання для enol-4G36-AMP та enol-4G37-AMP.
Імітовані спектри випромінювання, інтенсивність яких нормалізована з урахуванням найбільш інтенсивного спектру (enol-4G37-AMP) як еталонного значення 1, змінюючи конформацію білка та стан протонування AMP для (a) фенолат-кето та (b) фенолату енольні хімічні форми оксилуциферину.
Схематичне зображення біолюмінесцентної реакції світлячків, що показує першу (1) та другу (2) каталітичні реакції.
- Безкоштовне повнотекстове порівняння вмісту цинку, міді та селену в сирому, копченому та маринованому вигляді
- Безкоштовне повнотекстове лікування молекулами інгібітором ссавців Ste-20-подібної кінази 12 (MST12) XMU-MP-1
- Молекули Безкоштовне повнотекстове числове дослідження ультракороткого лазерно-аблятивного синтезу металу
- Повнотекстовий термічний стан, товщина та склад літосферної мантії
- Безкоштовний повнотекстовий імунний статус медичних наук пацієнтів з раком підшлункової залози, які отримують кріохірургію