Кандидати в антимікробні білки від Thermophilic Geobacillus sp. Штам ZGt-1: Виробництво, протеоміка та біоінформатичний аналіз

Антибактеріальна активність Geobacillus sp. штам ZGt-1 проти (а) штаму G. stearothermophilus 10; (b) B. subtilis; та (c) S. typhimurium CCUG 31969. Стрілки вказують на зону гальмування.

Антибактеріальна активність безклітинного супернатанту, отриманого послідовним періодичним культивуванням іммобілізованих клітин Geobacillus sp. ZGt-1 проти штаму G. stearothermophilus 10 при 60 ° C, наприкінці (а) циклу №1; (б) цикл №5; (c) цикли # 11, 12 та 13; (г) цикли # 14, 15, 16 та 17; (д) цикли # 24 і 25. Жовта крапка позначає місце, де був помічений супернатант; та (f) Короткий зміст антибактеріальної активності за 25 циклів, кількість символів +, що представляють зростаючий ступінь антибактеріальної активності.

Аналіз антибактеріальної активності знесоленої білкової фракції, виділеної з супернатанту культури, продукованого Geobacillus sp. ZGt-1 при 60 ° C. Випробовуваним організмом був штам G. stearothermophilus 10. Після поділу білка по SDS-PAGE у двох екземплярах гель розділили на дві частини, одну частину забарвлювали Coomassie Brilliant Blue R 250 (a), а іншу використовували для антибактеріального аналізу (b) . (а) Зображення білкової фракції, відокремленої від SDS-PAGE. Доріжка 1: стандарти Precision Plus Protein All Blue; Доріжка 2: Фракція знесоленого білка; (b) Антибактеріальна активність знесоленого білкового екстракту після його поділу на SDS-PAGE, відокремленому білку; гелеву смужку поміщали в чашку Петрі і покривали м'яким шаром агару, засіяним штамом 10 і інкубували при 60 ° С. Біла стрілка вказує на зону гальмування, що приписується антибактеріальній активності білкової фракції. Зона гальмування відповідала 15–20 кДа.

Робочий процес для ідентифікації потенційних кандидатів на антимікробний білок у Geobacillus sp. ZGt-1: Екстракт знесоленого білка з Geobacillus sp. ZGt-1 фракціонували за допомогою SDS-PAGE, з подальшим виявленням антибактеріальної активності на гелі проти досліджуваного мікроорганізму (М.О.) та аналізом активної зони за допомогою мас-спектрометрії. S: зразок, M: маркер білка в мультфільмах SDS-PAGE на схемі. Деталі експерименту наведені в тексті.

Анотація

білків

Антибактеріальна активність Geobacillus sp. штам ZGt-1 проти (а) штаму G. stearothermophilus 10; (b) B. subtilis; та (c) S. typhimurium CCUG 31969. Стрілки вказують на зону гальмування.

Антибактеріальна активність безклітинного супернатанту, отриманого послідовним періодичним культивуванням іммобілізованих клітин Geobacillus sp. ZGt-1 проти штаму G. stearothermophilus 10 при 60 ° C, наприкінці (а) циклу №1; (б) цикл №5; (c) цикли # 11, 12 та 13; (г) цикли # 14, 15, 16 та 17; (д) цикли # 24 і 25. Жовта крапка позначає місце, де був помічений супернатант; та (f) Короткий зміст антибактеріальної активності за 25 циклів, кількість символів +, що представляють зростаючий ступінь антибактеріальної активності.

Аналіз антибактеріальної активності знесоленої білкової фракції, виділеної з супернатанту культури, виробленого Geobacillus sp. ZGt-1 при 60 ° C. Тестовим організмом був штам G. stearothermophilus 10. Після поділу білка у SDS-PAGE у двох примірниках гель розділили на дві частини, одну частину фарбували Coomassie Brilliant Blue R 250 (a), а іншу використовували для антибактеріального аналізу (b) . (а) Зображення білкової фракції, відокремленої від SDS-PAGE. Доріжка 1: стандарти Precision Plus Protein All Blue; Доріжка 2: Фракція знесоленого білка; (b) антибактеріальна активність знесоленого білкового екстракту після його розділення на SDS-PAGE, відокремленому білку; гелеву смужку поміщали в чашку Петрі і покривали м'яким шаром агару, засіяним штамом 10 і інкубували при 60 ° С. Біла стрілка вказує на зону гальмування, що приписується антибактеріальній активності білкової фракції. Зона гальмування відповідала 15–20 кДа.

Робочий процес для ідентифікації потенційних кандидатів на антимікробний білок у Geobacillus sp. ZGt-1: Екстракт знесоленого білка з Geobacillus sp. ZGt-1 фракціонували за допомогою SDS-PAGE, з подальшим виявленням антибактеріальної активності на гелі проти досліджуваного мікроорганізму (М.О.) та аналізом активної зони за допомогою мас-спектрометрії. S: зразок, M: маркер білка в мультфільмах SDS-PAGE на схемі. Деталі експерименту наведені в тексті.

Додатковий матеріал

Поділіться та цитуйте

Алхалілі, Р.Н .; Бернфур, К .; Дішиша, Т .; Мамо, Г.; Щелін, Дж .; Канбек, Б .; Емануельссон, С .; Хатті-Каул, Р. Антимікробні білкові кандидати від Thermophilic Geobacillus sp. Штам ZGt-1: Виробництво, протеоміка та біоінформатичний аналіз. Міжнародний J. Mol. Наук. 2016 рік, 17, 1363.

Alkhalili RN, Bernfur K, Dishisha T, Mamo G, Schelin J, Canbäck B, Emanuelsson C, Hatti-Kaul R. Кандидати в антимікробні білки від Thermophilic Geobacillus sp. Штам ZGt-1: Виробництво, протеоміка та біоінформатичний аналіз. Міжнародний журнал молекулярних наук. 2016 рік; 17 (8): 1363.

Чиказький/Турабський стиль

Алхалілі, Равана Н .; Бернфур, Катя; Дішиша, Тарек; Мамо, Гашо; Щелін, Дженні; Канбек, Бьорн; Емануельссон, Сесілія; Хатті-Каул, Раджні. 2016. "Антимікробні білкові кандидати від Thermophilic Geobacillus sp. Штам ZGt-1: Виробництво, протеоміка та аналіз біоінформатики" Int. J. Mol. Наук. 17, № 8: 1363.