Виявлення мікробного дисбіозу, пов’язаного з дитячою хворобою Крона, незважаючи на високу варіабельність

Взаємна інформація відрізняє хворобу Крона та засоби контролю за допомогою мікробіома

Мікробіоми стільця і клубової кишки містять однакову інформацію про хворобу Крона

Мікроби, які більше містять в клубовій кишці, ніж у стільці, позитивно корелюють із хворобою Крона

Статистична сила виявлення асоціації сильно варіюється серед часто використовуваних методів

Резюме

Взаємозв'язок між господарем та його мікробіотою є складним для розуміння, оскільки як мікробні спільноти, так і їх середовище дуже мінливі. Ми розробили набір методів, заснованих на динаміці чисельності населення та теорії інформації, для вирішення цієї проблеми. Ці методи визначають додаткові бактеріальні таксони, пов’язані з дитячою хворобою Крона, і можуть виявити значні зміни в мікробних спільнотах з меншою кількістю зразків, ніж вимагали попередні статистичні підходи. Ми також значно покращили точність діагностики на основі мікробіоти з зразків стільця, і ми виявили, що екологічна ніша мікроба передбачає його роль у хворобі Крона. Бактерії, що зазвичай перебувають у просвіті здорових людей, зменшують кількість захворювань, тоді як бактерії, що зазвичай перебувають на слизовій оболонці здорових людей, збільшуються при захворюванні. Наші результати також показують, що асоціації із хворобою Крона еволюційно збережені і забезпечують взаємозаснований метод відображення дисбіозу.

Графічний реферат

Завантажити: Завантажити зображення з високою роздільною здатністю (187 КБ)
Завантажити: Завантажте повнорозмірне зображення

Попередній стаття у випуску Далі стаття у випуску