Структурна модуляція мікробіоти кишечника показує, що насіння Coix сприяє втраті ваги у мишей

Анотація

Це попередній перегляд вмісту передплати, увійдіть, щоб перевірити доступ.

Параметри доступу

Придбайте одну статтю

Миттєвий доступ до повної статті PDF.

Розрахунок податку буде завершено під час оформлення замовлення.

Підпишіться на журнал

Негайний онлайн-доступ до всіх випусків з 2019 року. Підписка буде автоматично поновлюватися щороку.

Розрахунок податку буде завершено під час оформлення замовлення.

мікробіоти

Список літератури

Barengolts E (2016) Кишкова мікробіота, пребіотики, пробіотики та синбіотики при лікуванні ожиріння та переддіабету: огляд рандомізованих контрольованих досліджень. Endocr Pract 22 (10): 1224–1234. https://doi.org/10.4158/EP151157.RA

Caesar R, Tremaroli V, Kovatcheva-Datchary P, Cani PD, Backhed F (2015) Перехресні зв’язки між мікробіотою кишечника та ліпідними речовинами в їжі посилюють запалення ВАТ за допомогою сигналізації TLR. Cell Metab 22 (4): 658–668. https://doi.org/10.1016/j.cmet.2015.07.026

Cani PD, de Vos WM (2017) Корисні мікроби наступного покоління: випадок Akkermansia muciniphila. Передній мікробіол 8: 1765. https://doi.org/10.3389/fmicb.2017.01765

Chang CJ, Lin CS, Lu CC, Martel J, Ko YF, Ojcius DM, Tseng SF, Wu TR, Chen YY, Young JD, Lai HC (2015) Ganoderma lucidum зменшує ожиріння у мишей, модулюючи склад мікробіоти кишечника. Nat Commun 6: 7489. https://doi.org/10.1038/ncomms8489

Chen HJ, Chung CP, Chiang W, Lin YL (2011) Протизапальний ефект та хімічне вивчення збагаченої флавоноїдами фракції з висівок із адлаю. Food Chem 126 (4): 1741–1748. https://doi.org/10.1016/j.foodchem.2010.12.074

Claesson MJ, Jeffery IB, Conde S, Power SE, O'Connor EM, Cusack S, Harris HM, Coakley M, Lakshminarayanan B, O'Sullivan O, Fitzgerald GF, Deane J, O'Connor M, Harnedy N, O ' Коннор К, О'Махоні Д, ван Синдерен Д, Уоллес М, Бреннан Л, Стентон С, Маркесі Дж., Фіцджеральд А.П., Шанахан Ф, Хілл С, Росс Р.П., О'Тул П.В. (2012) Склад мікробіоти кишечника корелює з дієтою та здоров'я у людей похилого віку. Nature 488 (7410): 178–184. https://doi.org/10.1038/nature11319

Clemente JC, Ursell LK, Parfrey LW, Knight R (2012) Вплив мікробіоти кишечника на здоров’я людини: інтегративний погляд. Осередок 148 (6): 1258–1270. https://doi.org/10.1016/j.cell.2012.01.035

Cotillard A, Kennedy SP, Kong LC, Prifti E, Pons N, Le Chatelier E, Almeida M, Quinquis B, Levenez F, Galleron N, Gougis S, Rizkalla S, Batto JM, Renault P, консорціум ANRM, Dore J, Zucker JD, Clement K, Ehrlich SD (2013) Дієтичне втручання впливає на багатство генів кишечника. Nature 500 (7464): 585–588. https://doi.org/10.1038/nature12480

Cowan TE, Palmnas MS, Yang J, Bomhof MR, Ardell KL, Reimer RA, Vogel HJ, Shearer J (2014) Хронічне споживання кави у страждаючих ожирінням щурів: вплив на мікробіоти кишечника та метаболоміку сироватки крові. J Nutr Biochem 25 (4): 489–495. https://doi.org/10.1016/j.jnutbio.2013.12.009

Dao MC, Everard A, Aron-Wisnewsky J, Sokolovska N, Prifti E, Verger EO, ​​Kayser BD, Levenez F, Chilloux J, Hoyles L, Consortium MI-O, Dumas ME, Rizkalla SW, Dore J, Cani PD, Clement K (2016) Akkermansia muciniphila та поліпшення метаболічного здоров’я під час дієтичного втручання при ожирінні: взаємозв’язок із багатством мікробіомів кишечника та екологією. Кишка 65 (3): 426–436. https://doi.org/10.1136/gutjnl-2014-308778

Де Філіппіс Ф, Пеллегріні Н, Ванніні Л, Джеффрі ІБ, Ла Сторія А, Лагі Л, Серразанетті Д.І., Ді Каньо Р, Феррочіно І, Лацци С, Турроні С, Коколін Л, Бригіді П, Невіані Е, Гоббетті М, О ' Toole PW, Ercolini D (2016) Дотримання високого рівня середземноморської дієти сприятливо впливає на мікробіоту кишечника та пов'язаний з ним метаболом. Кишка 65 (11): 1812–1821. https://doi.org/10.1136/gutjnl-2015-309957

De Filippo C, Cavalieri D, Di Paola M, Ramazzotti M, Poullet JB, Massart S, Collini S, Pieraccini G, Lionetti P (2010) Вплив дієти на формування мікробіоти кишечника, виявлене порівняльним дослідженням у дітей з Європи та сільської Африки . Proc Natl Acad Sci U S A 107 (33): 14691–14696. https://doi.org/10.1073/pnas.1005963107

Delzenne NM, Neyrinck AM, Backhed F, Cani PD (2011) Орієнтація на мікробіоти кишечника при ожирінні: ефекти пребіотиків та пробіотиків. Nat Rev Endocrinol 7 (11): 639–646. https://doi.org/10.1038/nrendo.2011.126

DeSantis TZ, Hugenholtz P, Larsen N, Rojas M, Brodie EL, Keller K, Huber T, Dalevi D, Hu P, Andersen GL (2006) Greengenes, перевірена химерою база даних генів 16S рРНК та робочий стіл, сумісний з ARB. Appl Environ Microbiol 72 (7): 5069–5072. https://doi.org/10.1128/AEM.03006-05

Egshatyan L, Kashtanova D, Popenko A, Tkacheva O, Tyaht A, Alexeev D, Karamnova N, Kostryukova E, Babenko V, Vahitova M, Boytsov S (2016) Мікробіота кишечника та дієта у пацієнтів з різною толерантністю до глюкози. Endocr Connect 5 (1): 1–9. https://doi.org/10.1530/EC-15-0094

Everard A, Belzer C, Geurts L, Ouwerkerk JP, Druart C, Bindels LB, Guiot Y, Derrien M, Muccioli GG, Delzenne NM, de Vos WM, Cani PD (2013) Перехресні розмови між Akkermansia muciniphila а кишковий епітелій контролює ожиріння, спричинене дієтою. Proc Natl Acad Sci U S A 110 (22): 9066–9071. https://doi.org/10.1073/pnas.1219451110

Gao X (2006) Прикладний ілюстрований збірник materia medica (китайсько-англійське видання). Преса іноземних мов

He Q, Li X, Liu C, Su L, Xia Z, Li X, Li Y, Li L, Yan T, Feng Q, Xiao L (2016) Дисбіоз калових мікробіоти в моделі мишей, спричиненої хворобою Крона, спричиненою TNBS. Appl Microbiol Biotechnol 100 (10): 4485–4494. https://doi.org/10.1007/s00253-015-7205-x

Гейдеманн А (2016) Огляд мишачої дієти з високим вмістом жиру як моделі для цукрового діабету 2 типу. J Diabetes Res 2016: 2902351. https://doi.org/10.1155/2016/2902351

Hu FB (2011) Глобалізація діабету: роль дієти, способу життя та генів. Догляд за діабетом 34 (6): 1249–1257. https://doi.org/10.2337/dc11-0442

Iantomasi T, Favilli F, Marraccini P, Magaldi T, Bruni P, Vincenzini MT (1997) Система транспортування глутатіону в епітеліальних клітинах тонкої кишки людини. Biochim Biophys Acta 1330 (2): 274–283

Kam J, Puranik S, Yadav R, Manwaring HR, Pierre S, Srivastava RK, Yadav RS (2016) Дієтичні втручання при цукровому діабеті 2 типу: як пшоно допомагає. Фронтальний завод Sci 7: 1454. https://doi.org/10.3389/fpls.2016.01454

Kim SO, Yun SJ, Jung B, Lee EH, Hahm DH, Shim I, Lee HJ (2004) Гіполіпідемічні ефекти сирого екстракту насіння адлей (Coix lachrymajobi var. майюен) при ожирінні щурів, що харчуються з високим вмістом жиру: співвідношення експресії мРНК TNF-альфа та лептину та рівня ліпідів у сироватці крові Life Sci 75 (11): 1391–1404. https://doi.org/10.1016/j.lfs.2004.03.006

Langille MG, Zaneveld J, Caporaso JG, McDonald D, Knights D, Reyes JA, Clemente JC, Burkepile DE, Vega Thurber RL, Knight R, Beiko RG, Huttenhower C (2013) Прогностичне функціональне профілювання мікробних спільнот з використанням маркера гена 16S рРНК послідовності. Nat Biotechnol 31 (9): 814–821. https://doi.org/10.1038/nbt.2676

Le Chatelier E, Nielsen T, Qin J, Prifti E, Hildebrand F, Falony G, Almeida M, Arumugam M, Batto JM, Kennedy S, Leonard P, Li J, Burgdorf K, Grarup N, Jorgensen T, Brandslund I, Nielsen HB, Юнкер А.С., Берталан М., Левенес Ф, Понс Н, Расмуссен С, Сунагава С, Тап Дж, Тимс С, Зойтендал Е.Г., Брунак С, Клемент К, Доре Дж, Клеребезем М, Крістіансен К, Рено П, Сіхеріц-Понтен T, de Vos WM, Zucker JD, Raes J, Hansen T, HITc M, Bork P, Wang J, Ehrlich SD, Pedersen O (2013) Багатство мікробіому кишечника людини корелює з метаболічними маркерами. Nature 500 (7464): 541–546. https://doi.org/10.1038/nature12506

Lecomte V, Kaakoush NO, Maloney CA, Raipuria M, Huinao KD, Mitchell HM, Morris MJ (2015) Зміни мікробіоти кишечника у щурів, які харчуються з високим вмістом жиру, корелюють із пов'язаними з ожирінням метаболічними показниками. PLoS One 10 (5): e0126931. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0126931

Ley RE, Turnbaugh PJ, Klein S, Gordon JI (2006) Мікробна екологія: мікроби кишечника людини, пов’язані з ожирінням. Nature 444 (7122): 1022–1023. https://doi.org/10.1038/4441022a

Лю Р, Хонг Дж, Сю Х, Фен Q, Чжан Д, Гу Ю, Ши Дж, Чжао С, Лю Ш, Ван Х, Ся Ч, Лю З, Цуй В, Лянг П, Сі Л, Цзінь Дж, Ін Х, Wang X, Zhao X, Li W, Jia H, Lan Z, Li F, Wang R, Sun Y, Yang M, Shen Y, Jie Z, Li J, Chen X, Zhong H, Xie H, Zhang Y, Gu W, Deng X, Shen B, Xu X, Yang H, Xu G, Bi Y, Lai S, Wang J, Qi L, Madsen L, Wang J, Ning G, Kristiansen K, Wang W (2017) Мікробіом і сироватка кишечника зміни метаболома при ожирінні та після втручання для схуднення. Nat Med 23 (7): 859–868. https://doi.org/10.1038/nm.4358

Lozupone C, Hamady M, Knight R (2006) UniFrac - Інтернет-інструмент для порівняння різноманітності мікробних спільнот у філогенетичному контексті. BMC Біоінформатика 7: 371. https://doi.org/10.1186/1471-2105-7-371

Parseus A, Sommer N, Sommer F, Caesar R, Molinaro A, Stahlman M, Greiner TU, Perkins R, Backhed F (2017) Ожиріння, спричинене мікробіотою, вимагає рецептора фарнезоїду X. Кишка 66 (3): 429–437. https://doi.org/10.1136/gutjnl-2015-310283

Patil KR, Nielsen J (2005) Розкриття транскрипційної регуляції метаболізму за допомогою топології метаболічної мережі. Proc Natl Acad Sci U S A 102 (8): 2685–2689. https://doi.org/10.1073/pnas.0406811102

Pedersen HK, Gudmundsdottir V, Nielsen HB, Hyotylainen T, Nielsen T, Jensen BA, Forslund K, Hildebrand F, Prifti E, Falony G, Le Chatelier E, Levenez F, Dore J, Mattila I, Plichta DR, Poho P, Hellgren LI, Arumugam M, Sunagawa S, Vieira-Silva S, Jorgensen T, Holm JB, Trost K, Meta HITC, Kristiansen K, Brix S, Raes J, Wang J, Hansen T, Bork P, Brunak S, Oresic M, Ehrlich SD, Pedersen O (2016) Мікроби кишечника людини впливають на метаболом сироватки крові та чутливість до інсуліну. Nature 535 (7612): 376–381. https://doi.org/10.1038/nature18646

Цинь J, Li Y, Cai Z, Li S, Zhu J, Zhang F, Liang S, Zhang W, Guan Y, Shen D, Peng Y, Zhang D, Jie Z, W W, Qin Y, Xue W, Li J, Han L, Lu D, Wu P, Dai Y, Sun X, Li Z, Tang A, Zhong S, Li X, Chen W, Xu R, Wang M, Feng Q, Gong M, Yu J, Zhang Y, Zhang M, Hansen T, Sanchez G, Raes J, Falony G, Okuda S, Almeida M, LeChatelier E, Renault P, Pons N, Batto JM, Zhang Z, Chen H, Yang R, Zheng W, Li S, Yang H, Wang J, Ehrlich SD, Nielsen R, Pedersen O, Kristiansen K, Wang J (2012) Дослідження асоціації метагенома мікрофлори кишечника при цукровому діабеті 2 типу. Nature 490 (7418): 55–60. https://doi.org/10.1038/nature11450

Rabot S, Membrez M, Blancher F, Berger B, Moine D, Krause L, Bibiloni R, Bruneau A, Gerard P, Siddharth J, Lauber CL, Chou CJ (2016) Дієта з високим вмістом жиру сприяє ожирінню незалежно від складу мікробіоти кишечника в мишей. Sci Rep 6: 32484. https://doi.org/10.1038/srep32484

Рей Ф.Е., Гонсалес, доктор медичних наук, Ченг Дж, Ву М, Ахерн П.П., Гордон СІ (2013) Метаболічна ніша видатної сульфат-редукуючої бактерії кишечника людини Proc Natl Acad Sci U S A 110 (33): 13582–13587. https://doi.org/10.1073/pnas.1312524110

Schloss PD, Westcott SL, Ryabin T, Hall JR, Hartmann M, Hollister EB, Lesniewski RA, Oakley BB, Parks DH, Robinson CJ, Sahl JW, Stres B, Thallinger GG, Van Horn DJ, Weber CF (2009) Представляємо мотур: програмне забезпечення для опису та порівняння мікробних спільнот з відкритим вихідним кодом, незалежне від платформи програмне забезпечення, яке підтримується громадою. Appl Environ Microbiol 75 (23): 7537–7541. https://doi.org/10.1128/AEM.01541-09

Serino M, Luche E, Gres S, Baylac A, Berge M, Cenac C, Waget A, Klopp P, Iacovoni J, Klopp C, Mariette J, Bouchez O, Lluch J, Ouarne F, Monsan P, Valet P, Roques C, Amar J, Bouloumie A, Theodorou V, Burcelin R (2012) Метаболічна адаптація до дієти з високим вмістом жиру пов’язана зі зміною мікробіоти кишечника. Кишка 61 (4): 543–553. https://doi.org/10.1136/gutjnl-2011-301012

Tabak AG, Herder C, Rathmann W, Brunner EJ, Kivimaki M (2012) Предіабет: стан високого ризику розвитку діабету. Ланцет 379 (9833): 2279–2290. https://doi.org/10.1016/S0140-6736(12)60283-9

Turnbaugh PJ, Hamady M, Yatsunenko T, Cantarel BL, Duncan A, Ley RE, Sogin ML, Jones WJ, Roe BA, Affourtit JP, Egholm M, Henrissat B, Heath AC, Knight R, Gordon JI (2009) Основна кишка мікробіом у ожирених та худих близнюків. Nature 457 (7228): 480–484. https://doi.org/10.1038/nature07540

Wallace JL, Vong L, McKnight W, Dicay M, Martin GR (2009) Ендогенний та екзогенний сірководень сприяє вирішенню коліту у щурів. Гастроентерологія 137 (2): 569–578. https://doi.org/10.1053/j.gastro.2009.04.012

Wang YC, McPherson K, Marsh T, Gortmaker SL, Brown M (2011) Здоров'я та економічне навантаження від прогнозованих тенденцій ожиріння в США та Великобританії. Ланцет 378 (9793): 815–825. https://doi.org/10.1016/S0140-6736(11)60814-3

Wang L, Sun J, Yi Q, Wang X, Ju X (2012) Захисна дія поліфенольного екстракту адлаю (Coix lachryma-jobi L. var. ма-юєнь Stapf) на індукований гіперхолестеринемією окислювальний стрес у щурів. Молекули 17 (8): 8886–8897. https://doi.org/10.3390/molecules17088886

Wang Q, Du Z, Zhang H, Zhao L, Sun J, Zheng X, Ren F (2015) Модуляція мікробіоти кишечника поліфенолами з адлей (Coix lacryma-jobi L. var. ма-юєнь Stapf.) У щурів, які харчуються дієтою з високим вмістом холестерину. Int J Food Sci Nutr 66 (7): 783–789. https://doi.org/10.3109/09637486.2015.1088941

Wang D, Yang C, Wang Z, Yang Y, Li D, Ding X, Xu W, Zheng Q (2017a) Норкантаридин у поєднанні з олією насіння Coix синергічно індукує апоптоз та інгібує ріст гепатоцелюлярної карциноми, знижуючи регуляцію накопичення регуляторних Т-клітин. Sci Rep 7 (1): 9373. https://doi.org/10.1038/s41598-017-09668-2

Wang Y, Zhang C, Zhang S, Zhao Z, Wang J, Song J, Wang Y, Liu J, Hou S (2017b) Канглаїт сенсибілізує клітини раку прямої кишки до таксолу через інгібування NF-kappaBeta та регуляцію коннексину 43. Sci Rep 7 (1): 1280. https://doi.org/10.1038/s41598-017-01480-2

Xu J, Lian F, Zhao L, Zhao Y, Chen X, Zhang X, Guo Y, Zhang C, Zhou Q, Xue Z, Pang X, Zhao L, Tong X (2015) Структурна модуляція мікробіоти кишечника під час полегшення типу 2 діабет з китайською рослинною сумішшю. ISME J 9 (3): 552–562. https://doi.org/10.1038/ismej.2014.177

Yeh PH, Chiang W, Chiang MT (2006) Вплив очищеного адлею на концентрацію глюкози та ліпідів у плазмі крові у діабетичних щурів, індукованих стрептозотоцином, що отримували дієту, збагачену холестерином. Int J Vitam Nutr Res 76 (5): 299–305. https://doi.org/10.1024/0300-9831.76.5.299

Запала М.А., Шорк Нью-Джерсі (2006) Багатовимірний регресійний аналіз матриць відстані для тестування асоціацій між моделями експресії генів та відповідними змінними. Proc Natl Acad Sci U S A 103 (51): 19430–19435. https://doi.org/10.1073/pnas.0609333103

Чжао Л, Чжан Ф, Дінг Х, Ву Г, Лам ЮЙ, Ван Х, Фу Х, Сюе Х, Лу С, Ма Дж, Ю Л, Сю С, Рен З, Сю Ю, Сю С, Шень Х, Чжу Х, Shi Y, Shen Q, Dong W, Liu R, Ling Y, Zeng Y, Wang X, Zhang Q, Wang J, Wang L, Wu Y, Zeng B, Wei H, Zhang M, Peng Y, Zhang C (2018 ) Кишкові бактерії, які вибірково просуваються харчовими волокнами, полегшують діабет 2 типу. Science 359 (6380): 1151–1156. https://doi.org/10.1126/science.aao5774

Zhou D, Pan Q, Xin FZ, Zhang RN, He CX, Chen GY, Liu C, Chen YW, Fan JG (2017). World J Gastroenterol 23 (1): 60–75. https://doi.org/10.3748/wjg.v23.i1.60

Zou J, Chassaing B, Singh V, Pellizzon M, Ricci M, Fythe MD, Kumar MV, Gewirtz AT (2018) Волоконно-опосередковане живлення мікробіоти кишечника захищає від ожиріння, спричиненого дієтою, відновлюючи здоров’я товстої кишки, опосередковане IL-22. Мікроб, що приймає клітини, 23 (1): 41–53. https://doi.org/10.1016/j.chom.2017.11.003

Подяка

Автори дякують колегам з BGI-Shenzhen за технічну підтримку та допомогу.

Фінансування

Цю роботу підтримали гранти муніципального уряду Китаю (гранти № CXZZ20150330171521403).

Інформація про автора

Приналежності

Освітній центр BGI, Університет Китайської академії наук, головний корпус, промислова зона Бейшань, район Янтянь, Шеньчжень, 518083, Китай

Шен Лю, Фей Лі і Сюцин Чжан

Ви також можете шукати цього автора в PubMed Google Scholar

Ви також можете шукати цього автора в PubMed Google Scholar

Ви також можете шукати цього автора в PubMed Google Scholar

Внески

X.Z. задумав і керував проектом. Ф.Л. проведено лікування та відбір проб. С.Л. провів аналіз даних та написав рукопис. X.Z. сприяв перегляду рукопису.

Відповідний автор

Декларації про етику

Конфлікт інтересів

Автори заявляють, що у них немає конфлікту інтересів.

Етичне схвалення

Було дотримано всіх чинних міжнародних, національних та/або інституційних вказівок щодо догляду та використання тварин.

Додаткова інформація

Примітка видавця

Springer Nature залишається нейтральним щодо юрисдикційних вимог в опублікованих картах та інституційних приналежностей.