Кок

Коки зазвичай групують у пари (дипло), ланцюжки (стрепто) або скупчення (стафіло), утворюючи диплококи, стрептококи та стафілококи.

Пов’язані терміни:

Рід
Протеаза
Ферменти
Мутація
Білки
ДНК
Молочнокислі бактерії
Дріжджі
Пептидази

Завантажити у форматі PDF

Про цю сторінку

Стрептококи та супутні коки

Пов’язані коки

Аеробні

Лейконосток, Педіокок

Види цих родів не мають ветеринарного значення.

Аерокок

Коки цього роду утворюють тетради. Раніше їх називали Гаффк’я. Aerococcus viridans був причетний до сечових інфекцій та ендокардитів людини та до летального захворювання омарів (гафкемія).

Джемелла

Коки цього роду трапляються поодиноко або попарно із сусідніми сторонами, сплощеними. Вони відновлюються з дихальних шляхів людини.

Анаеробні коки

Пептокок

Цей рід включає анаеробні коки, які трапляються поодиноко, парами, тетрадами або неправильними масами. Один з видів описаний у Посібнику Берджі і, ймовірно, є комменсалом людини, у якого він іноді викликає інфекції.

Пептострептокок

Коки цього роду зустрічаються поодиноко, парами та короткими або довгими ланцюжками. Всі вони потребують анаеробної атмосфери для початкової ізоляції; однак при подальшій субкультурі деякі штами будуть рости мікроаерофільно або аеробно. Дев'ять видів описані в Посібнику Берджі, і всі вони, мабуть, є комменсалами у людей. Деякі з них були причетні до різних інфекцій, включаючи інфекції ран, післяпологову лихоманку, плеврит, апендицит, синусит, стоматологічні інфекції, артрити, абсцеси та вагініт. Два види, P. anaerobicus та P. indolicum, викликають подібні інфекції у тварин.

Румінокок

Ці кулясті або видовжені коккоїдні організми містяться в звичайному рубці великої рогатої худоби та овець та в кишковому тракті кроликів. Вони не мають патогенного значення.

Копрокок

Ці клітини округлі до видовжених, і повідомляється про три види: C. eutactus, C. comes і C. catus. Усі види були ізольовані від калу людини.

Сарчина

Ці сферичні клітини містяться в пакетах по вісім і більше. Один із двох описаних видів, Sarcina ventriculi, вилучений із вмісту шлунку кроликів та морських свинок. Вони не причетні до хвороб.

Щоб отримати додаткову інформацію про значення та ідентифікацію цих коків, зверніться до Посібника Берджі та Посібника лабораторії Анаероб (10).

БАКТЕРІЇ МОЛОЧНОЇ КИСЛОТИ

Рід Enterococcus

Мікрокок і стафілокок

Інші коки

На додаток до стафілококів, інші грампозитивні коки асоціюються з людьми та тваринами як загалом нешкідливі коменсали. Більшість із них включені до перелічених нижче родів. Номенклатура - це Посібник Бергі (9). Вони мало або взагалі не мають значення як причини захворювань у тварин, але випадково вони зустрічаються в клінічних матеріалах.

Мікрокок

Ці коки морфологічно нагадують стафілококи і трапляються поодиноко та в скупченнях різного розміру. Вони грампозитивні до грам-змінних, і зустрічаються як рухомі, так і нерухливі штами. Деякі колонії не пігментовані. Cowan and Steel (10) відрізняють стафілококи від деяких видів мікрококів на основі тесту O-F (див. Додаток B). Більшість стафілококів розщеплюють цукру шляхом ферментації, тоді як ті види мікрококів, які розщеплюють цукор, роблять це окисно (див. Таблицю 16-1). Модифіковані тести на оксидазу та бензидин, стійкість до лізоциму та лізостафіну, вироблення кислоти в середовищі гліцерин-еритроміцин та ріст на селективному середовищі Шлейфера та Крамера є додатковими тестами для диференціації стафілококів від мікрококів (11, 12). Ці процедури слід включати, коли потрібна остаточна ідентифікація ізоляту.

Планокок

Це рухливі непатогенні коки, які трапляються поодиноко і парами, тріадами або тетрадами. Вони містяться в морській воді і рідко зустрічаються в клінічних матеріалах.

Стоматокок

Це нерухливі непатогенні коки, які трапляються здебільшого скупченнями. Вони вважаються нормальним мешканцем рота і верхніх дихальних шляхів людини. Про анаеробні роди Sarcina та Peptococcus буде сказано в главі 15. Gaffkya більше не визнається родом (9).

Математика робить мікроби красивими, корисними та щедрими

7.3 Плавання вгору за течією або рухливість у багатьох вимірах: “Життя при низьких числах Рейнольдса”

Для бактеріальних коків і паличок довжиною лише близько мікрона діаметр таких клітин недостатній, щоб відчути різницю в хімічному градієнті концентрації. Проте ми часто спостерігаємо, як бактерії рухаються до джерела їжі або від шкідливого агента. Як ми можемо вирішити таку аномалію?

Стрептокок

Індраніл Саманта, Саміран Бандіопадхай, в антимікробній стійкості в сільському господарстві, 2020

Морфологія

Стрептококи - це грампозитивні коки, капсульовані, не спорові та не рухомі. Кожна клітина кока має діаметр 1 мкм. Вони розташовані в парі або ланцюжку клітин, оскільки поділ клітини відбувається в одній площині. Формування ланцюга та довжина ланцюга є змінними. Streptococcus equi ssp. equi - це постійний виробник ланцюга, інші види - ні. Молоді культури є грампозитивними, тоді як бактерії, присутні в гної, та старі культури в лабораторії часто фарбуються як грамнегативні.

Стрептококова капсула має полісахаридну природу. Капсули S. equi, S. pyogenes виготовлені з неантигенних гіалуронових кислот, що містять повторювані одиниці глюкуронової кислоти та N-ацетил-глюкозаміну. Синтез полімеру включає продукти трьох генів, hasA, hasB та hasC, які знаходяться в одному опероні.

У стрептококів групи А, під капсулою, присутня клітинна стінка. Ця клітинна стінка має три шари. Самий зовнішній шар містить три основні поверхневі білки: М, Т і Р. Серед них М-білок є антифагоцитарним та основним фактором вірулентності. Він кодується геном emm. Структура М-білка складається з ділянок повтору A, B, C та D, за якими слідує якір білка та місце розщеплення пепсину. Якірна область містить мотив LPXTGX, необхідний для закріплення грампозитивних білків у мембрані клітини-господаря. Середній шар клітинної стінки складається з вуглеводного антигену групи (С-речовини). Внутрішній шар клітинної стінки складається з пептидоглікану. Пептидоглікан може стимулювати вироблення ендогенного пірогену та діяти як хемоаттрактант для лейкоцитів. Тейхоєві кислоти містяться в клітинній стінці стрептококів, як і інші грампозитивні бактерії.

ПОЧАТКОВІ КУЛЬТУРИ | Важливість вибраних родів

Ентерокок

Морфологічно ентерококи - це коки, які мають тенденцію утворювати ланцюжки різної довжини. Вони продукують l-ізомер молочної кислоти. Окрім здатності рости при 45 ° C, при pH 9,6, у високих концентраціях солі, у високих концентраціях солей жовчі, їх загальній теплостійкості та нечутливості до ряду антимікробних засобів, вони зовні нагадують лактококи. До останніх таксономічних досліджень види Enterococcus, які використовувались як закваски, класифікували як фекальні стрептококи та стрептококи групи D. Вони є нормальними мешканцями кишкового тракту людини та інших тварин і часто використовуються в мікробіології як показники забруднення калу; деякі види є патогенами.

Види, що знаходяться або використовуються як кустарні культури або в спеціалізованих сирах, включають Enterococcus faecalis та Enterococcus faecium; Enterococcus durans, який також використовується у виробництві сирів, належить до групи E. faecium.

Визначення ентерококів стартовими бактеріями є суперечливим. Існує занепокоєння щодо безпеки ентерококів у продуктах харчування з кількох причин, включаючи здатність деяких штамів викликати внутрішньолікарняні інфекції та виробляти біоаміни. Біоаміни, такі як гістамін, путресцин, тирамін та кадаверин, утворюються під дією амінокислотних декарбоксилаз і можуть спричиняти головний біль та інші фізіологічні ефекти. Однак інші LAB також можуть виробляти декарбоксилази амінокислот, і перед початковим використанням рекомендується проводити скринінг нових штамів на вироблення біоамінів.

Однак їх здатність обмінюватися стійкими до антибіотиків генами, однак, особливо щодо глікопептидних антибіотиків (ванкоміцин та тейкопланін), можливо, викликає найбільше занепокоєння. Ванкоміцин - один із лише невеликої кількості антибіотиків, який може бути ефективним проти метицилінорезистентного золотистого стафілокока.

Тим не менше, ентерококи часто зустрічаються у кустарних сирних заквасках та ферментованих м'ясних продуктах у високих концентраціях і протягом багатьох років використовуються як пробіотики, особливо при лікуванні стійкої діареї. Здатність деяких заквасок ентерококів швидко виробляти кислоту в молоці, рости в присутності 6,5% солі і виробляти кислоту при температурах, що використовуються при обпалюванні деяких сирів, свідчить про те, що вони особливо придатні для використання як закваски з сиру.

EFSA провела оцінку QPS щодо E. faecium у 2010 році і дійшла висновку, що не доцільно робити це для виду в цілому, і що перед вживанням будь-якого штаму Enterococcus у їжу слід проводити оцінку безпеки для конкретного штаму. Ця точка зору була прийнята, оскільки все ще існує певна невизначеність щодо детермінант вірулентності в ентерококах.

Ідентифіковані гени ознак вірулентності, пов'язані з прихильністю до тканини хазяїна, інвазією та утворенням абсцесів, модуляцією запальних реакцій господаря та секрецією токсичних продуктів (наприклад, біоамінів), і їх можна легко визначити.

Бактерії та бактеріофаги як біологічні агенти для боротьби із захворюваннями в аквакультурі

14.7.2 Фаготерапія інфекції Lactococcus garvieae у жовтохвоста

Грампозитивні коки L. garvieae є етіологічним агентом лактококової інфекції жовтохвіста Seriola quinqueradiata, що призводить до системної рибної інфекції, яка вражає кишечник, печінку, селезінку та нирки (Kusuda et al., 1991). Експериментально летальність настає протягом короткого часу (2–3 дні) постінфекції (Itami et al., 1996). L. garvieae є умовно-патогенним мікроорганізмом, який є повсюдним у риб і передається фекально-оральним шляхом (Kitao et al., 1979). L. garvieae відрізняється великою фенотиповою неоднорідністю та генетичним різноманіттям серед ізолятів (Vela et al., 2000). Висока смертність від хвороби жовтохвоста та розвиток стійкості до антибіотиків вимагали розробки додаткових засобів для її контролю (Kawanishi et al., 2005).

Виділено літичні фаги, специфічні для L. garvieae (Park et al., 1997, і три з цих фагів оцінювали на предмет їх стійкості в різних умовах, їхньої долі в жовтохвості та здатності захищати рибу від експериментально індукованого L. інфекція garvieae (Nakai et al., 1999). Кожен фаг був стабільнішим у стерилізованій воді, ніж у нестерилізованій природній морській воді, і титри фагів зменшувались із підвищенням температури після нанесення на корм, після інкубації з сироваткою жовтохвостих або коли рН був нижчим за 3,5 (Nakai et al., 1999). Коли фагу L. garvieae широкого розподілу (PLgY-16) вводили жовтохвісту шляхом внутрішньовенного введення, він з’являвся в селезінці риби через 3 год після введення і не виявлявся через 48 год після введення (Nakai et al., 1999). У кишечнику фаги відновлювались до 3 год після введення при пероральному введенні у фаг-просочені корми. Одночасне введення фага та L. garvieae призвело до віднов дуже фагів із селезінки до п’яти днів після в/в. введення та відновлення з кишечника до 24 год після перорального прийому. Ці результати свідчать про те, що ці фаги здатні мігрувати в місця зараження всередині риби.

Моніторинг якості води в аквакультурі

12.2.2.3 Стрептокок

Стрептокок - рід коків (кулястих) грампозитивних бактерій, що належать до типу Firmicutes (Ryan and Ray, 2004) і до лактобактерій (молочнокислі бактерії). Поділ клітин у цього роду відбувається вздовж однієї осі цих бактерій, отже, вони ростуть ланцюжками або парами, тобто легко згинаються або скручуються, як ланцюг (скручений ланцюг).

Більшість з них є негативними щодо оксидази та каталази, а багато - факультативними анаеробами.

У 1984 р. Багато бактерій, які раніше вважалися стрептококами, були виділені в роди Enterococcus та Lactococcus (Facklam, 2002). В даний час в цьому роду визнано понад 50 видів. Встановлено, що цей рід є частиною мікробіому слини (Wang et al., 2016).

Агенти нових інфекційних хвороб

Інфекції золотистого стафілокока

Цей грампозитивний аеробний кок є одним з найбільш повсюдних мікроорганізмів у людських популяціях і відповідає за широкий спектр захворювань людини, від простих шкірних «фурункулів» до загрозливих для життя генералізованих інфекцій. За останні кілька десятиліть з’явилися нові клінічні утворення, пов’язані з S. aureus, такі як синдром токсичного шоку стафілококів (STSS), який є потенційно смертельною хворобою, опосередкованою токсином „суперантигену” (TSST-1) і характеризується лихоманкою, гіпотонія, мультисистемна недостатність органів та еритематозні висипання, які десквамуються під час одужання. TSST-1 - це неспецифічний Т-клітинний мітоген, який призводить до різкого збільшення Т-клітин і подальшого збільшення циркулюючих цитокінів. Цей синдром спочатку був описаний в умовах колонізації піхви штамами, що продукують токсини, та використання супервсмоктуючих тампонів у 1978 р. Цей тип тампонів був вилучений з ринку, і захворюваність знизилася. Однак неменструальні форми існують і пов’язані з ущільненням носа, хірургічними ранами та іншими вогнищевими інфекціями S. aureus. Подібний стан, що спостерігається у новонароджених, нещодавно був описаний в Японії і відомий як екзантематозна хвороба, подібна до синдрому токсичного шоку новонароджених.

Резистентність до антибіотиків є основною проблемою внутрішньолікарняних інфекцій через S. aureus. Як стійкі до метициліну, так і стійкі до глікопептидів штами є основною загрозою в лікарняних умовах. S. aureus може входити до нормальної флори, особливо до ніг і шкіри. Інші місця включають сечостатеві шляхи, слизові оболонки, шлунково-кишковий тракт та верхні дихальні шляхи. Насправді більшість інфекцій вважаються ендогенними за походженням.

Коагулазонегативні стафілококи також з'явились як патогени людини в умовах постійних катетерів та біопротезів. Ці бактерії здатні утворювати великі біоплівки на інертних поверхнях, що призводять до місцевих або системних інфекцій.

Грампозитивні інфекції

Рід Р. Громан DVM, DACVIM (внутрішня медицина), DACVECC, у галузі медицини критичної допомоги дрібним тваринам (друге видання), 2015

Ентерококові інфекції

Види ентерококів - факультативні анаеробні коки, які демонструють внутрішню та набуту стійкість до множинних антибіотиків. На відміну від стрептококів та стафілококів, більшість ентерококів не виробляють надійно набору прозапальних токсинів, але вони оснащені багатьма генами, які опосередковують адгезію до тканин господаря. 7 Ентерококи (раніше стрептококи групи D), як випливає з назви, - це коменсальні бактерії, які населяють шлунково-кишковий тракт тварин і людини. 9,12 Ентерококові інфекції раніше вважались рідкісними, і не особливо вірулентними, у тварин-компаньонів. В даний час ентерококові інфекції є основною причиною внутрішньолікарняних захворювань в охороні здоров'я людини, а патогенні та стійкі до різних лікарських засобів (МЛУ) ентерококи все частіше відновлюються у госпіталізованих ветеринарних пацієнтів. 1,11

Найчастіше спостерігаються післяопераційні рани та сечостатеві інфекції; однак у тварин-компаньонів повідомлялося про ентерококовий холангіогепатит, перитоніт, вегетативний ендокардит, мастит та інфекції, що передаються через кров. 11,19 Багато ентерококів є внутрішньо стійкими до численних антибіотиків, і вважається, що розвиток ентерококів МЛУ є наслідком невідповідного використання антимікробних препаратів та поганих заходів боротьби з інфекцією у госпіталізованих пацієнтів. 11,12,19 Більшість клінічних ізолятів належать до виду Enterococcus faecalis, хоча Enterococcus faecium залишається видом, який виявляє непропорційно більшу стійкість до множинних антибіотиків. 11,19

На жаль, деякі ентерококи стійкі до аміноглікозидів, навіть при одночасному застосуванні з ампіциліном, залишаючи мало альтернатив для лікування цих інфекцій. 7,11 У деяких випадках єдиними ефективними препаратами є глікопептиди, такі як ванкоміцин, але цей препарат слід розглядати як терапію в крайньому випадку. 2 Ванкоміцин має вузький спектр і потенційно є нефротоксичним (див. Розділ 181). Клінічний досвід застосування ванкоміцину у ветеринарній медицині обмежений.